Protein–RNA interactions for Protein: P51965

UBE2E1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 E1, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2E1P51965 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
UBE2E1P51965 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
UBE2E1P51965 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
UBE2E1P51965 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
UBE2E1P51965 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
UBE2E1P51965 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
UBE2E1P51965 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
UBE2E1P51965 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
UBE2E1P51965 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
UBE2E1P51965 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
UBE2E1P51965 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
UBE2E1P51965 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
UBE2E1P51965 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
UBE2E1P51965 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
UBE2E1P51965 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
UBE2E1P51965 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
UBE2E1P51965 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
UBE2E1P51965 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
UBE2E1P51965 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
UBE2E1P51965 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
UBE2E1P51965 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
UBE2E1P51965 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
UBE2E1P51965 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
UBE2E1P51965 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
UBE2E1P51965 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
UBE2E1P51965 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
UBE2E1P51965 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
UBE2E1P51965 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
UBE2E1P51965 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
UBE2E1P51965 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
UBE2E1P51965 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
UBE2E1P51965 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
UBE2E1P51965 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
UBE2E1P51965 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
UBE2E1P51965 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
UBE2E1P51965 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
UBE2E1P51965 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.75
UBE2E1P51965 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
UBE2E1P51965 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
UBE2E1P51965 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
UBE2E1P51965 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
UBE2E1P51965 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
UBE2E1P51965 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
UBE2E1P51965 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
UBE2E1P51965 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
UBE2E1P51965 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
UBE2E1P51965 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
UBE2E1P51965 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
UBE2E1P51965 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
UBE2E1P51965 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
UBE2E1P51965 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
UBE2E1P51965 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
UBE2E1P51965 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
UBE2E1P51965 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
UBE2E1P51965 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
UBE2E1P51965 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
UBE2E1P51965 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
UBE2E1P51965 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
UBE2E1P51965 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
UBE2E1P51965 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
UBE2E1P51965 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
UBE2E1P51965 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
UBE2E1P51965 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
UBE2E1P51965 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
UBE2E1P51965 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
UBE2E1P51965 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
UBE2E1P51965 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
UBE2E1P51965 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
UBE2E1P51965 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
UBE2E1P51965 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
UBE2E1P51965 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
UBE2E1P51965 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
UBE2E1P51965 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
UBE2E1P51965 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
UBE2E1P51965 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
UBE2E1P51965 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
UBE2E1P51965 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
UBE2E1P51965 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
UBE2E1P51965 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
UBE2E1P51965 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
UBE2E1P51965 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
UBE2E1P51965 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
UBE2E1P51965 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
UBE2E1P51965 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
UBE2E1P51965 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
UBE2E1P51965 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
UBE2E1P51965 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
UBE2E1P51965 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
UBE2E1P51965 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
UBE2E1P51965 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
UBE2E1P51965 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
UBE2E1P51965 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
UBE2E1P51965 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
UBE2E1P51965 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
UBE2E1P51965 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
UBE2E1P51965 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
UBE2E1P51965 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
UBE2E1P51965 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
UBE2E1P51965 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
UBE2E1P51965 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms