Protein–RNA interactions for Protein: P51587

BRCA2, Breast cancer type 2 susceptibility protein, humanhuman

Predictions only

Length 3,418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRCA2P51587 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
BRCA2P51587 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
BRCA2P51587 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
BRCA2P51587 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
BRCA2P51587 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
BRCA2P51587 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
BRCA2P51587 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
BRCA2P51587 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC27.81■■■□□ 2.04
BRCA2P51587 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
BRCA2P51587 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
BRCA2P51587 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
BRCA2P51587 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
BRCA2P51587 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
BRCA2P51587 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
BRCA2P51587 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
BRCA2P51587 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
BRCA2P51587 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
BRCA2P51587 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
BRCA2P51587 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
BRCA2P51587 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
BRCA2P51587 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
BRCA2P51587 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
BRCA2P51587 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
BRCA2P51587 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC27.78■■■□□ 2.04
BRCA2P51587 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
BRCA2P51587 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
BRCA2P51587 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
BRCA2P51587 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
BRCA2P51587 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
BRCA2P51587 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
BRCA2P51587 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
BRCA2P51587 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
BRCA2P51587 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
BRCA2P51587 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
BRCA2P51587 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
BRCA2P51587 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
BRCA2P51587 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
BRCA2P51587 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
BRCA2P51587 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
BRCA2P51587 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
BRCA2P51587 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC27.75■■■□□ 2.03
BRCA2P51587 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
BRCA2P51587 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
BRCA2P51587 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
BRCA2P51587 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
BRCA2P51587 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
BRCA2P51587 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
BRCA2P51587 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
BRCA2P51587 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC27.74■■■□□ 2.03
BRCA2P51587 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
BRCA2P51587 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
BRCA2P51587 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
BRCA2P51587 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
BRCA2P51587 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
BRCA2P51587 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
BRCA2P51587 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
BRCA2P51587 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
BRCA2P51587 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
BRCA2P51587 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
BRCA2P51587 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
BRCA2P51587 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
BRCA2P51587 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
BRCA2P51587 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
BRCA2P51587 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
BRCA2P51587 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
BRCA2P51587 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.03
BRCA2P51587 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
BRCA2P51587 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
BRCA2P51587 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
BRCA2P51587 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
BRCA2P51587 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
BRCA2P51587 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
BRCA2P51587 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
BRCA2P51587 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
BRCA2P51587 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
BRCA2P51587 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC27.68■■■□□ 2.02
BRCA2P51587 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
BRCA2P51587 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
BRCA2P51587 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
BRCA2P51587 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
BRCA2P51587 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
BRCA2P51587 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
BRCA2P51587 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
BRCA2P51587 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
BRCA2P51587 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
BRCA2P51587 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
BRCA2P51587 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
BRCA2P51587 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
BRCA2P51587 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
BRCA2P51587 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
BRCA2P51587 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
BRCA2P51587 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC27.65■■■□□ 2.02
BRCA2P51587 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
BRCA2P51587 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
BRCA2P51587 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
BRCA2P51587 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
BRCA2P51587 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
BRCA2P51587 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
BRCA2P51587 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
BRCA2P51587 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC27.64■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 108 ms