Protein–RNA interactions for Protein: P50876

RNF144A, E3 ubiquitin-protein ligase RNF144A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF144AP50876 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RNF144AP50876 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RNF144AP50876 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RNF144AP50876 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RNF144AP50876 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RNF144AP50876 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RNF144AP50876 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RNF144AP50876 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RNF144AP50876 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RNF144AP50876 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RNF144AP50876 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RNF144AP50876 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RNF144AP50876 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RNF144AP50876 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RNF144AP50876 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RNF144AP50876 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
RNF144AP50876 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RNF144AP50876 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RNF144AP50876 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RNF144AP50876 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RNF144AP50876 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RNF144AP50876 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RNF144AP50876 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
RNF144AP50876 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
RNF144AP50876 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RNF144AP50876 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RNF144AP50876 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RNF144AP50876 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RNF144AP50876 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RNF144AP50876 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RNF144AP50876 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
RNF144AP50876 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RNF144AP50876 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
RNF144AP50876 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RNF144AP50876 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RNF144AP50876 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RNF144AP50876 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RNF144AP50876 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RNF144AP50876 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RNF144AP50876 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
RNF144AP50876 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RNF144AP50876 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RNF144AP50876 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
RNF144AP50876 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RNF144AP50876 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RNF144AP50876 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RNF144AP50876 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RNF144AP50876 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RNF144AP50876 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RNF144AP50876 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RNF144AP50876 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RNF144AP50876 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RNF144AP50876 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RNF144AP50876 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
RNF144AP50876 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RNF144AP50876 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RNF144AP50876 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RNF144AP50876 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RNF144AP50876 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RNF144AP50876 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RNF144AP50876 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RNF144AP50876 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RNF144AP50876 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RNF144AP50876 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RNF144AP50876 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RNF144AP50876 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RNF144AP50876 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RNF144AP50876 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RNF144AP50876 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RNF144AP50876 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RNF144AP50876 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RNF144AP50876 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RNF144AP50876 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
RNF144AP50876 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RNF144AP50876 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RNF144AP50876 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RNF144AP50876 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RNF144AP50876 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RNF144AP50876 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RNF144AP50876 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RNF144AP50876 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RNF144AP50876 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RNF144AP50876 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RNF144AP50876 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RNF144AP50876 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RNF144AP50876 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RNF144AP50876 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RNF144AP50876 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RNF144AP50876 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RNF144AP50876 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RNF144AP50876 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RNF144AP50876 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RNF144AP50876 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RNF144AP50876 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RNF144AP50876 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RNF144AP50876 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RNF144AP50876 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RNF144AP50876 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RNF144AP50876 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
RNF144AP50876 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms