Protein–RNA interactions for Protein: P50549

ETV1, ETS translocation variant 1, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ETV1P50549 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ETV1P50549 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
ETV1P50549 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ETV1P50549 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ETV1P50549 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ETV1P50549 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ETV1P50549 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ETV1P50549 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ETV1P50549 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ETV1P50549 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ETV1P50549 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ETV1P50549 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ETV1P50549 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ETV1P50549 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ETV1P50549 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ETV1P50549 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ETV1P50549 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ETV1P50549 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ETV1P50549 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ETV1P50549 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ETV1P50549 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ETV1P50549 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ETV1P50549 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ETV1P50549 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ETV1P50549 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ETV1P50549 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ETV1P50549 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ETV1P50549 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ETV1P50549 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ETV1P50549 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ETV1P50549 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ETV1P50549 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ETV1P50549 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ETV1P50549 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ETV1P50549 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ETV1P50549 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ETV1P50549 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ETV1P50549 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ETV1P50549 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ETV1P50549 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ETV1P50549 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ETV1P50549 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ETV1P50549 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ETV1P50549 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ETV1P50549 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ETV1P50549 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ETV1P50549 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ETV1P50549 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ETV1P50549 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ETV1P50549 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ETV1P50549 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ETV1P50549 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ETV1P50549 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ETV1P50549 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ETV1P50549 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
ETV1P50549 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
ETV1P50549 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
ETV1P50549 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ETV1P50549 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ETV1P50549 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ETV1P50549 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ETV1P50549 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ETV1P50549 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ETV1P50549 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
ETV1P50549 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ETV1P50549 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ETV1P50549 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ETV1P50549 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ETV1P50549 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ETV1P50549 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ETV1P50549 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ETV1P50549 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ETV1P50549 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ETV1P50549 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ETV1P50549 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ETV1P50549 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ETV1P50549 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ETV1P50549 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ETV1P50549 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ETV1P50549 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ETV1P50549 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ETV1P50549 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ETV1P50549 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ETV1P50549 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ETV1P50549 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ETV1P50549 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ETV1P50549 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ETV1P50549 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ETV1P50549 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ETV1P50549 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ETV1P50549 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ETV1P50549 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ETV1P50549 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ETV1P50549 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ETV1P50549 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ETV1P50549 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ETV1P50549 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ETV1P50549 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ETV1P50549 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ETV1P50549 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.8 ms