Protein–RNA interactions for Protein: P50542

PEX5, Peroxisomal targeting signal 1 receptor, humanhuman

Predictions only

Length 639 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX5P50542 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PEX5P50542 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PEX5P50542 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PEX5P50542 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PEX5P50542 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PEX5P50542 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PEX5P50542 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PEX5P50542 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC25.58■■□□□ 1.68
PEX5P50542 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
PEX5P50542 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PEX5P50542 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PEX5P50542 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
PEX5P50542 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PEX5P50542 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PEX5P50542 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
PEX5P50542 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PEX5P50542 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
PEX5P50542 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PEX5P50542 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PEX5P50542 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PEX5P50542 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PEX5P50542 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PEX5P50542 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PEX5P50542 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PEX5P50542 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PEX5P50542 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
PEX5P50542 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PEX5P50542 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PEX5P50542 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PEX5P50542 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PEX5P50542 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PEX5P50542 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PEX5P50542 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PEX5P50542 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PEX5P50542 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PEX5P50542 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PEX5P50542 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PEX5P50542 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PEX5P50542 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PEX5P50542 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PEX5P50542 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PEX5P50542 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PEX5P50542 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PEX5P50542 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PEX5P50542 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PEX5P50542 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PEX5P50542 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PEX5P50542 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PEX5P50542 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PEX5P50542 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PEX5P50542 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PEX5P50542 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PEX5P50542 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PEX5P50542 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PEX5P50542 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PEX5P50542 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PEX5P50542 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PEX5P50542 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PEX5P50542 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PEX5P50542 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PEX5P50542 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PEX5P50542 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PEX5P50542 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PEX5P50542 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PEX5P50542 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PEX5P50542 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PEX5P50542 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PEX5P50542 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PEX5P50542 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PEX5P50542 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PEX5P50542 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PEX5P50542 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PEX5P50542 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PEX5P50542 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PEX5P50542 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PEX5P50542 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PEX5P50542 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PEX5P50542 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PEX5P50542 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
PEX5P50542 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PEX5P50542 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PEX5P50542 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PEX5P50542 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PEX5P50542 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PEX5P50542 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PEX5P50542 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PEX5P50542 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
PEX5P50542 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PEX5P50542 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PEX5P50542 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PEX5P50542 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PEX5P50542 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
PEX5P50542 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PEX5P50542 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PEX5P50542 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
PEX5P50542 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PEX5P50542 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PEX5P50542 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PEX5P50542 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PEX5P50542 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms