Protein–RNA interactions for Protein: P50238

CRIP1, Cysteine-rich protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 77 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRIP1P50238 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CRIP1P50238 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CRIP1P50238 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CRIP1P50238 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CRIP1P50238 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CRIP1P50238 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CRIP1P50238 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CRIP1P50238 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CRIP1P50238 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CRIP1P50238 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CRIP1P50238 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CRIP1P50238 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CRIP1P50238 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CRIP1P50238 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CRIP1P50238 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CRIP1P50238 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CRIP1P50238 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CRIP1P50238 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
CRIP1P50238 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CRIP1P50238 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
CRIP1P50238 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CRIP1P50238 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CRIP1P50238 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CRIP1P50238 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CRIP1P50238 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CRIP1P50238 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CRIP1P50238 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CRIP1P50238 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CRIP1P50238 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CRIP1P50238 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CRIP1P50238 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CRIP1P50238 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CRIP1P50238 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CRIP1P50238 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CRIP1P50238 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CRIP1P50238 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CRIP1P50238 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CRIP1P50238 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CRIP1P50238 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CRIP1P50238 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CRIP1P50238 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CRIP1P50238 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CRIP1P50238 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CRIP1P50238 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CRIP1P50238 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CRIP1P50238 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CRIP1P50238 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CRIP1P50238 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CRIP1P50238 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CRIP1P50238 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CRIP1P50238 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CRIP1P50238 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CRIP1P50238 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CRIP1P50238 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CRIP1P50238 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CRIP1P50238 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CRIP1P50238 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CRIP1P50238 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CRIP1P50238 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CRIP1P50238 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CRIP1P50238 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CRIP1P50238 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CRIP1P50238 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CRIP1P50238 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CRIP1P50238 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CRIP1P50238 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CRIP1P50238 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CRIP1P50238 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CRIP1P50238 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CRIP1P50238 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CRIP1P50238 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CRIP1P50238 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CRIP1P50238 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CRIP1P50238 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CRIP1P50238 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CRIP1P50238 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CRIP1P50238 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CRIP1P50238 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CRIP1P50238 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CRIP1P50238 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CRIP1P50238 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CRIP1P50238 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CRIP1P50238 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CRIP1P50238 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CRIP1P50238 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CRIP1P50238 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CRIP1P50238 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CRIP1P50238 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CRIP1P50238 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CRIP1P50238 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CRIP1P50238 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CRIP1P50238 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CRIP1P50238 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CRIP1P50238 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CRIP1P50238 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CRIP1P50238 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CRIP1P50238 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CRIP1P50238 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CRIP1P50238 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CRIP1P50238 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms