Protein–RNA interactions for Protein: P49247

RPIA, Ribose-5-phosphate isomerase, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPIAP49247 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RPIAP49247 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RPIAP49247 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RPIAP49247 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RPIAP49247 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RPIAP49247 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RPIAP49247 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
RPIAP49247 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RPIAP49247 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RPIAP49247 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RPIAP49247 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RPIAP49247 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RPIAP49247 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RPIAP49247 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RPIAP49247 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RPIAP49247 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RPIAP49247 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
RPIAP49247 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
RPIAP49247 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RPIAP49247 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RPIAP49247 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RPIAP49247 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RPIAP49247 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RPIAP49247 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RPIAP49247 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RPIAP49247 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RPIAP49247 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RPIAP49247 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RPIAP49247 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RPIAP49247 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
RPIAP49247 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RPIAP49247 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RPIAP49247 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RPIAP49247 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
RPIAP49247 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RPIAP49247 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RPIAP49247 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
RPIAP49247 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RPIAP49247 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RPIAP49247 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
RPIAP49247 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RPIAP49247 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RPIAP49247 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RPIAP49247 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RPIAP49247 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RPIAP49247 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RPIAP49247 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RPIAP49247 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RPIAP49247 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RPIAP49247 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RPIAP49247 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RPIAP49247 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RPIAP49247 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RPIAP49247 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RPIAP49247 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RPIAP49247 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
RPIAP49247 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
RPIAP49247 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RPIAP49247 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RPIAP49247 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
RPIAP49247 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RPIAP49247 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RPIAP49247 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RPIAP49247 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RPIAP49247 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
RPIAP49247 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RPIAP49247 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RPIAP49247 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RPIAP49247 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RPIAP49247 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RPIAP49247 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RPIAP49247 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RPIAP49247 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RPIAP49247 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RPIAP49247 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RPIAP49247 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RPIAP49247 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RPIAP49247 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
RPIAP49247 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RPIAP49247 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RPIAP49247 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RPIAP49247 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RPIAP49247 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RPIAP49247 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RPIAP49247 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RPIAP49247 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RPIAP49247 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RPIAP49247 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RPIAP49247 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RPIAP49247 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RPIAP49247 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RPIAP49247 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RPIAP49247 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RPIAP49247 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RPIAP49247 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RPIAP49247 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RPIAP49247 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RPIAP49247 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RPIAP49247 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RPIAP49247 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.9 ms