Protein–RNA interactions for Protein: P48165

GJA8, Gap junction alpha-8 protein, humanhuman

Predictions only

Length 433 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA8P48165 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
GJA8P48165 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
GJA8P48165 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
GJA8P48165 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
GJA8P48165 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
GJA8P48165 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
GJA8P48165 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
GJA8P48165 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
GJA8P48165 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
GJA8P48165 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
GJA8P48165 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
GJA8P48165 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
GJA8P48165 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
GJA8P48165 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
GJA8P48165 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
GJA8P48165 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
GJA8P48165 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
GJA8P48165 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
GJA8P48165 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
GJA8P48165 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
GJA8P48165 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
GJA8P48165 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
GJA8P48165 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC27.56■■■□□ 2
GJA8P48165 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
GJA8P48165 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
GJA8P48165 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
GJA8P48165 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
GJA8P48165 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
GJA8P48165 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
GJA8P48165 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
GJA8P48165 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
GJA8P48165 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
GJA8P48165 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
GJA8P48165 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
GJA8P48165 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
GJA8P48165 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
GJA8P48165 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC27.54■■■□□ 2
GJA8P48165 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
GJA8P48165 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC27.54■■■□□ 2
GJA8P48165 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC27.53■■■□□ 2
GJA8P48165 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
GJA8P48165 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
GJA8P48165 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC27.53■■■□□ 2
GJA8P48165 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC27.53■■■□□ 2
GJA8P48165 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC27.53■■■□□ 2
GJA8P48165 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC27.53■■■□□ 2
GJA8P48165 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
GJA8P48165 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
GJA8P48165 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
GJA8P48165 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC27.52■■■□□ 2
GJA8P48165 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC27.52■■■□□ 2
GJA8P48165 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
GJA8P48165 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
GJA8P48165 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
GJA8P48165 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC27.51■■□□□ 1.99
GJA8P48165 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
GJA8P48165 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
GJA8P48165 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
GJA8P48165 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
GJA8P48165 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
GJA8P48165 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
GJA8P48165 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
GJA8P48165 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
GJA8P48165 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
GJA8P48165 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
GJA8P48165 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
GJA8P48165 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
GJA8P48165 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
GJA8P48165 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
GJA8P48165 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
GJA8P48165 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
GJA8P48165 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
GJA8P48165 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
GJA8P48165 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
GJA8P48165 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
GJA8P48165 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
GJA8P48165 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
GJA8P48165 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
GJA8P48165 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
GJA8P48165 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
GJA8P48165 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC27.45■■□□□ 1.98
GJA8P48165 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
GJA8P48165 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
GJA8P48165 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
GJA8P48165 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
GJA8P48165 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
GJA8P48165 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
GJA8P48165 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
GJA8P48165 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
GJA8P48165 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
GJA8P48165 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
GJA8P48165 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
GJA8P48165 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC27.43■■□□□ 1.98
GJA8P48165 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
GJA8P48165 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
GJA8P48165 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
GJA8P48165 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
GJA8P48165 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
GJA8P48165 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
GJA8P48165 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms