Protein–RNA interactions for Protein: P46098

HTR3A, 5-hydroxytryptamine receptor 3A, humanhuman

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTR3AP46098 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HTR3AP46098 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HTR3AP46098 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HTR3AP46098 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HTR3AP46098 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HTR3AP46098 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HTR3AP46098 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HTR3AP46098 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HTR3AP46098 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HTR3AP46098 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HTR3AP46098 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HTR3AP46098 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HTR3AP46098 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HTR3AP46098 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HTR3AP46098 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HTR3AP46098 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HTR3AP46098 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HTR3AP46098 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HTR3AP46098 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HTR3AP46098 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HTR3AP46098 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HTR3AP46098 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HTR3AP46098 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HTR3AP46098 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HTR3AP46098 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HTR3AP46098 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HTR3AP46098 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HTR3AP46098 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
HTR3AP46098 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HTR3AP46098 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HTR3AP46098 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HTR3AP46098 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HTR3AP46098 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HTR3AP46098 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HTR3AP46098 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HTR3AP46098 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HTR3AP46098 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HTR3AP46098 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HTR3AP46098 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HTR3AP46098 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HTR3AP46098 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HTR3AP46098 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HTR3AP46098 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HTR3AP46098 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HTR3AP46098 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
HTR3AP46098 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HTR3AP46098 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HTR3AP46098 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HTR3AP46098 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HTR3AP46098 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HTR3AP46098 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HTR3AP46098 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HTR3AP46098 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HTR3AP46098 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HTR3AP46098 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HTR3AP46098 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HTR3AP46098 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HTR3AP46098 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HTR3AP46098 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HTR3AP46098 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HTR3AP46098 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
HTR3AP46098 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
HTR3AP46098 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
HTR3AP46098 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HTR3AP46098 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HTR3AP46098 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HTR3AP46098 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HTR3AP46098 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HTR3AP46098 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HTR3AP46098 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HTR3AP46098 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HTR3AP46098 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HTR3AP46098 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HTR3AP46098 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
HTR3AP46098 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HTR3AP46098 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HTR3AP46098 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HTR3AP46098 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HTR3AP46098 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HTR3AP46098 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
HTR3AP46098 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HTR3AP46098 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HTR3AP46098 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HTR3AP46098 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HTR3AP46098 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HTR3AP46098 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HTR3AP46098 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HTR3AP46098 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HTR3AP46098 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HTR3AP46098 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HTR3AP46098 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HTR3AP46098 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HTR3AP46098 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HTR3AP46098 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HTR3AP46098 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HTR3AP46098 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HTR3AP46098 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HTR3AP46098 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HTR3AP46098 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
HTR3AP46098 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms