Protein–RNA interactions for Protein: P42772

CDKN2B, Cyclin-dependent kinase 4 inhibitor B, humanhuman

Predictions only

Length 138 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN2BP42772 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CDKN2BP42772 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CDKN2BP42772 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CDKN2BP42772 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CDKN2BP42772 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CDKN2BP42772 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CDKN2BP42772 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CDKN2BP42772 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CDKN2BP42772 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CDKN2BP42772 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CDKN2BP42772 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CDKN2BP42772 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CDKN2BP42772 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CDKN2BP42772 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CDKN2BP42772 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CDKN2BP42772 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CDKN2BP42772 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CDKN2BP42772 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CDKN2BP42772 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CDKN2BP42772 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CDKN2BP42772 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CDKN2BP42772 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CDKN2BP42772 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CDKN2BP42772 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CDKN2BP42772 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
CDKN2BP42772 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CDKN2BP42772 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CDKN2BP42772 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CDKN2BP42772 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CDKN2BP42772 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CDKN2BP42772 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CDKN2BP42772 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CDKN2BP42772 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CDKN2BP42772 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CDKN2BP42772 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CDKN2BP42772 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
CDKN2BP42772 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CDKN2BP42772 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CDKN2BP42772 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CDKN2BP42772 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CDKN2BP42772 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CDKN2BP42772 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CDKN2BP42772 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CDKN2BP42772 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CDKN2BP42772 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CDKN2BP42772 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CDKN2BP42772 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CDKN2BP42772 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CDKN2BP42772 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CDKN2BP42772 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CDKN2BP42772 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CDKN2BP42772 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CDKN2BP42772 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CDKN2BP42772 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CDKN2BP42772 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CDKN2BP42772 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CDKN2BP42772 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CDKN2BP42772 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CDKN2BP42772 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CDKN2BP42772 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CDKN2BP42772 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CDKN2BP42772 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CDKN2BP42772 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CDKN2BP42772 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CDKN2BP42772 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CDKN2BP42772 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CDKN2BP42772 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CDKN2BP42772 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CDKN2BP42772 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CDKN2BP42772 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CDKN2BP42772 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
CDKN2BP42772 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CDKN2BP42772 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CDKN2BP42772 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CDKN2BP42772 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
CDKN2BP42772 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CDKN2BP42772 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CDKN2BP42772 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CDKN2BP42772 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CDKN2BP42772 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CDKN2BP42772 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CDKN2BP42772 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
CDKN2BP42772 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CDKN2BP42772 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CDKN2BP42772 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CDKN2BP42772 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CDKN2BP42772 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CDKN2BP42772 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CDKN2BP42772 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CDKN2BP42772 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
CDKN2BP42772 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CDKN2BP42772 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CDKN2BP42772 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
CDKN2BP42772 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CDKN2BP42772 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CDKN2BP42772 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CDKN2BP42772 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CDKN2BP42772 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CDKN2BP42772 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CDKN2BP42772 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms