Protein–RNA interactions for Protein: P41271

NBL1, Neuroblastoma suppressor of tumorigenicity 1, humanhuman

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBL1P41271 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NBL1P41271 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NBL1P41271 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NBL1P41271 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NBL1P41271 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NBL1P41271 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NBL1P41271 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NBL1P41271 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NBL1P41271 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
NBL1P41271 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NBL1P41271 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NBL1P41271 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NBL1P41271 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
NBL1P41271 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NBL1P41271 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NBL1P41271 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NBL1P41271 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
NBL1P41271 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NBL1P41271 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NBL1P41271 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NBL1P41271 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NBL1P41271 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NBL1P41271 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
NBL1P41271 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NBL1P41271 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
NBL1P41271 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NBL1P41271 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NBL1P41271 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NBL1P41271 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NBL1P41271 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NBL1P41271 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NBL1P41271 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NBL1P41271 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NBL1P41271 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NBL1P41271 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NBL1P41271 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NBL1P41271 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NBL1P41271 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
NBL1P41271 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
NBL1P41271 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
NBL1P41271 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NBL1P41271 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NBL1P41271 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NBL1P41271 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
NBL1P41271 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NBL1P41271 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
NBL1P41271 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NBL1P41271 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NBL1P41271 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
NBL1P41271 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NBL1P41271 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NBL1P41271 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NBL1P41271 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NBL1P41271 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
NBL1P41271 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NBL1P41271 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NBL1P41271 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NBL1P41271 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NBL1P41271 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NBL1P41271 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NBL1P41271 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NBL1P41271 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NBL1P41271 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NBL1P41271 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NBL1P41271 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NBL1P41271 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NBL1P41271 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NBL1P41271 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NBL1P41271 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NBL1P41271 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NBL1P41271 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NBL1P41271 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NBL1P41271 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NBL1P41271 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NBL1P41271 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NBL1P41271 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NBL1P41271 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NBL1P41271 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NBL1P41271 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NBL1P41271 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NBL1P41271 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NBL1P41271 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NBL1P41271 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NBL1P41271 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NBL1P41271 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NBL1P41271 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NBL1P41271 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
NBL1P41271 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
NBL1P41271 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
NBL1P41271 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NBL1P41271 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NBL1P41271 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NBL1P41271 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NBL1P41271 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NBL1P41271 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NBL1P41271 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NBL1P41271 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NBL1P41271 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
NBL1P41271 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NBL1P41271 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.6 ms