Protein–RNA interactions for Protein: P41238

APOBEC1, C->U-editing enzyme APOBEC-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC1P41238 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
APOBEC1P41238 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
APOBEC1P41238 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
APOBEC1P41238 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
APOBEC1P41238 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
APOBEC1P41238 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
APOBEC1P41238 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
APOBEC1P41238 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
APOBEC1P41238 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
APOBEC1P41238 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
APOBEC1P41238 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
APOBEC1P41238 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
APOBEC1P41238 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
APOBEC1P41238 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
APOBEC1P41238 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
APOBEC1P41238 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
APOBEC1P41238 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
APOBEC1P41238 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
APOBEC1P41238 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
APOBEC1P41238 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
APOBEC1P41238 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
APOBEC1P41238 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
APOBEC1P41238 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
APOBEC1P41238 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
APOBEC1P41238 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
APOBEC1P41238 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
APOBEC1P41238 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
APOBEC1P41238 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
APOBEC1P41238 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
APOBEC1P41238 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
APOBEC1P41238 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
APOBEC1P41238 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
APOBEC1P41238 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
APOBEC1P41238 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
APOBEC1P41238 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
APOBEC1P41238 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
APOBEC1P41238 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
APOBEC1P41238 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
APOBEC1P41238 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
APOBEC1P41238 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
APOBEC1P41238 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
APOBEC1P41238 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
APOBEC1P41238 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
APOBEC1P41238 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
APOBEC1P41238 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
APOBEC1P41238 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
APOBEC1P41238 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
APOBEC1P41238 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
APOBEC1P41238 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
APOBEC1P41238 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
APOBEC1P41238 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
APOBEC1P41238 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22■■□□□ 1.11
APOBEC1P41238 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
APOBEC1P41238 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
APOBEC1P41238 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
APOBEC1P41238 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
APOBEC1P41238 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
APOBEC1P41238 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
APOBEC1P41238 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
APOBEC1P41238 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
APOBEC1P41238 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
APOBEC1P41238 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
APOBEC1P41238 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
APOBEC1P41238 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
APOBEC1P41238 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
APOBEC1P41238 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
APOBEC1P41238 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
APOBEC1P41238 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
APOBEC1P41238 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
APOBEC1P41238 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
APOBEC1P41238 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
APOBEC1P41238 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
APOBEC1P41238 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
APOBEC1P41238 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
APOBEC1P41238 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
APOBEC1P41238 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
APOBEC1P41238 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
APOBEC1P41238 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
APOBEC1P41238 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
APOBEC1P41238 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
APOBEC1P41238 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
APOBEC1P41238 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
APOBEC1P41238 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
APOBEC1P41238 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
APOBEC1P41238 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
APOBEC1P41238 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
APOBEC1P41238 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
APOBEC1P41238 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
APOBEC1P41238 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
APOBEC1P41238 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
APOBEC1P41238 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
APOBEC1P41238 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
APOBEC1P41238 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
APOBEC1P41238 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
APOBEC1P41238 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
APOBEC1P41238 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
APOBEC1P41238 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
APOBEC1P41238 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
APOBEC1P41238 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
APOBEC1P41238 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.5 ms