Protein–RNA interactions for Protein: P37268

FDFT1, Squalene synthase, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FDFT1P37268 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
FDFT1P37268 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
FDFT1P37268 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
FDFT1P37268 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
FDFT1P37268 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
FDFT1P37268 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
FDFT1P37268 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
FDFT1P37268 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
FDFT1P37268 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
FDFT1P37268 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
FDFT1P37268 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
FDFT1P37268 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
FDFT1P37268 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
FDFT1P37268 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
FDFT1P37268 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
FDFT1P37268 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
FDFT1P37268 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
FDFT1P37268 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
FDFT1P37268 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
FDFT1P37268 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
FDFT1P37268 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
FDFT1P37268 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
FDFT1P37268 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
FDFT1P37268 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
FDFT1P37268 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
FDFT1P37268 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
FDFT1P37268 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
FDFT1P37268 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
FDFT1P37268 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
FDFT1P37268 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
FDFT1P37268 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
FDFT1P37268 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
FDFT1P37268 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
FDFT1P37268 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
FDFT1P37268 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
FDFT1P37268 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
FDFT1P37268 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
FDFT1P37268 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
FDFT1P37268 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
FDFT1P37268 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
FDFT1P37268 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
FDFT1P37268 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
FDFT1P37268 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
FDFT1P37268 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
FDFT1P37268 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
FDFT1P37268 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
FDFT1P37268 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
FDFT1P37268 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
FDFT1P37268 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
FDFT1P37268 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
FDFT1P37268 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
FDFT1P37268 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
FDFT1P37268 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
FDFT1P37268 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
FDFT1P37268 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
FDFT1P37268 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
FDFT1P37268 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
FDFT1P37268 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
FDFT1P37268 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
FDFT1P37268 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
FDFT1P37268 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
FDFT1P37268 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
FDFT1P37268 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
FDFT1P37268 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
FDFT1P37268 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
FDFT1P37268 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
FDFT1P37268 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
FDFT1P37268 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
FDFT1P37268 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
FDFT1P37268 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
FDFT1P37268 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
FDFT1P37268 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
FDFT1P37268 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
FDFT1P37268 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
FDFT1P37268 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
FDFT1P37268 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
FDFT1P37268 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
FDFT1P37268 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
FDFT1P37268 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
FDFT1P37268 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
FDFT1P37268 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
FDFT1P37268 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
FDFT1P37268 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
FDFT1P37268 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
FDFT1P37268 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
FDFT1P37268 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
FDFT1P37268 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
FDFT1P37268 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
FDFT1P37268 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
FDFT1P37268 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
FDFT1P37268 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
FDFT1P37268 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
FDFT1P37268 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
FDFT1P37268 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
FDFT1P37268 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
FDFT1P37268 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
FDFT1P37268 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
FDFT1P37268 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
FDFT1P37268 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
FDFT1P37268 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.8 ms