Protein–RNA interactions for Protein: P36896

ACVR1B, Activin receptor type-1B, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACVR1BP36896 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ACVR1BP36896 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ACVR1BP36896 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ACVR1BP36896 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
ACVR1BP36896 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ACVR1BP36896 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ACVR1BP36896 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ACVR1BP36896 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ACVR1BP36896 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ACVR1BP36896 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ACVR1BP36896 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ACVR1BP36896 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ACVR1BP36896 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ACVR1BP36896 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ACVR1BP36896 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ACVR1BP36896 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ACVR1BP36896 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ACVR1BP36896 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ACVR1BP36896 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ACVR1BP36896 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ACVR1BP36896 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ACVR1BP36896 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ACVR1BP36896 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ACVR1BP36896 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ACVR1BP36896 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ACVR1BP36896 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ACVR1BP36896 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ACVR1BP36896 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ACVR1BP36896 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ACVR1BP36896 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ACVR1BP36896 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ACVR1BP36896 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ACVR1BP36896 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
ACVR1BP36896 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ACVR1BP36896 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ACVR1BP36896 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ACVR1BP36896 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ACVR1BP36896 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ACVR1BP36896 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ACVR1BP36896 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ACVR1BP36896 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ACVR1BP36896 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ACVR1BP36896 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
ACVR1BP36896 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ACVR1BP36896 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ACVR1BP36896 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ACVR1BP36896 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ACVR1BP36896 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ACVR1BP36896 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ACVR1BP36896 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ACVR1BP36896 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ACVR1BP36896 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ACVR1BP36896 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ACVR1BP36896 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ACVR1BP36896 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ACVR1BP36896 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ACVR1BP36896 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ACVR1BP36896 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ACVR1BP36896 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ACVR1BP36896 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ACVR1BP36896 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ACVR1BP36896 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ACVR1BP36896 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ACVR1BP36896 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ACVR1BP36896 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ACVR1BP36896 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
ACVR1BP36896 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ACVR1BP36896 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ACVR1BP36896 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
ACVR1BP36896 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ACVR1BP36896 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ACVR1BP36896 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ACVR1BP36896 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ACVR1BP36896 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ACVR1BP36896 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
ACVR1BP36896 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ACVR1BP36896 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ACVR1BP36896 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ACVR1BP36896 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
ACVR1BP36896 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ACVR1BP36896 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ACVR1BP36896 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ACVR1BP36896 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ACVR1BP36896 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ACVR1BP36896 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ACVR1BP36896 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ACVR1BP36896 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ACVR1BP36896 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ACVR1BP36896 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ACVR1BP36896 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ACVR1BP36896 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ACVR1BP36896 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ACVR1BP36896 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ACVR1BP36896 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
ACVR1BP36896 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
ACVR1BP36896 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
ACVR1BP36896 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ACVR1BP36896 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ACVR1BP36896 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ACVR1BP36896 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.8 ms