Protein–RNA interactions for Protein: P36873

PPP1CC, Serine/threonine-protein phosphatase PP1-gamma catalytic subunit, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP1CCP36873 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PPP1CCP36873 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PPP1CCP36873 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PPP1CCP36873 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PPP1CCP36873 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PPP1CCP36873 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PPP1CCP36873 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PPP1CCP36873 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PPP1CCP36873 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PPP1CCP36873 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PPP1CCP36873 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PPP1CCP36873 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PPP1CCP36873 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PPP1CCP36873 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PPP1CCP36873 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PPP1CCP36873 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PPP1CCP36873 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PPP1CCP36873 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PPP1CCP36873 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PPP1CCP36873 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PPP1CCP36873 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PPP1CCP36873 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PPP1CCP36873 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
PPP1CCP36873 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PPP1CCP36873 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PPP1CCP36873 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PPP1CCP36873 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PPP1CCP36873 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PPP1CCP36873 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PPP1CCP36873 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PPP1CCP36873 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PPP1CCP36873 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PPP1CCP36873 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
PPP1CCP36873 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PPP1CCP36873 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PPP1CCP36873 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PPP1CCP36873 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PPP1CCP36873 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PPP1CCP36873 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PPP1CCP36873 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PPP1CCP36873 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PPP1CCP36873 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PPP1CCP36873 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
PPP1CCP36873 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PPP1CCP36873 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PPP1CCP36873 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PPP1CCP36873 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PPP1CCP36873 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PPP1CCP36873 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
PPP1CCP36873 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PPP1CCP36873 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PPP1CCP36873 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
PPP1CCP36873 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
PPP1CCP36873 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PPP1CCP36873 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PPP1CCP36873 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PPP1CCP36873 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PPP1CCP36873 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PPP1CCP36873 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PPP1CCP36873 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PPP1CCP36873 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PPP1CCP36873 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PPP1CCP36873 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PPP1CCP36873 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PPP1CCP36873 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PPP1CCP36873 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PPP1CCP36873 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PPP1CCP36873 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PPP1CCP36873 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PPP1CCP36873 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PPP1CCP36873 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PPP1CCP36873 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PPP1CCP36873 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PPP1CCP36873 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
PPP1CCP36873 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
PPP1CCP36873 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PPP1CCP36873 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PPP1CCP36873 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PPP1CCP36873 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PPP1CCP36873 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PPP1CCP36873 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PPP1CCP36873 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PPP1CCP36873 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PPP1CCP36873 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PPP1CCP36873 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PPP1CCP36873 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
PPP1CCP36873 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PPP1CCP36873 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PPP1CCP36873 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PPP1CCP36873 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PPP1CCP36873 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PPP1CCP36873 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PPP1CCP36873 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PPP1CCP36873 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PPP1CCP36873 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PPP1CCP36873 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PPP1CCP36873 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PPP1CCP36873 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PPP1CCP36873 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PPP1CCP36873 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55 ms