Protein–RNA interactions for Protein: P36542

ATP5C1, ATP synthase subunit gamma, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5C1P36542 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ATP5C1P36542 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ATP5C1P36542 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ATP5C1P36542 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
ATP5C1P36542 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ATP5C1P36542 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ATP5C1P36542 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ATP5C1P36542 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ATP5C1P36542 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ATP5C1P36542 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ATP5C1P36542 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ATP5C1P36542 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ATP5C1P36542 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ATP5C1P36542 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
ATP5C1P36542 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ATP5C1P36542 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ATP5C1P36542 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ATP5C1P36542 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ATP5C1P36542 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
ATP5C1P36542 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ATP5C1P36542 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
ATP5C1P36542 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
ATP5C1P36542 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
ATP5C1P36542 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ATP5C1P36542 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ATP5C1P36542 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ATP5C1P36542 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ATP5C1P36542 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ATP5C1P36542 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ATP5C1P36542 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ATP5C1P36542 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ATP5C1P36542 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
ATP5C1P36542 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ATP5C1P36542 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ATP5C1P36542 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ATP5C1P36542 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ATP5C1P36542 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ATP5C1P36542 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ATP5C1P36542 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ATP5C1P36542 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ATP5C1P36542 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ATP5C1P36542 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ATP5C1P36542 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
ATP5C1P36542 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ATP5C1P36542 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ATP5C1P36542 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ATP5C1P36542 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ATP5C1P36542 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ATP5C1P36542 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ATP5C1P36542 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ATP5C1P36542 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ATP5C1P36542 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ATP5C1P36542 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ATP5C1P36542 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ATP5C1P36542 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ATP5C1P36542 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ATP5C1P36542 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ATP5C1P36542 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ATP5C1P36542 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ATP5C1P36542 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ATP5C1P36542 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ATP5C1P36542 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ATP5C1P36542 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ATP5C1P36542 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ATP5C1P36542 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ATP5C1P36542 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ATP5C1P36542 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ATP5C1P36542 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ATP5C1P36542 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ATP5C1P36542 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ATP5C1P36542 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ATP5C1P36542 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ATP5C1P36542 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ATP5C1P36542 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ATP5C1P36542 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ATP5C1P36542 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ATP5C1P36542 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ATP5C1P36542 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ATP5C1P36542 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ATP5C1P36542 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ATP5C1P36542 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ATP5C1P36542 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ATP5C1P36542 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ATP5C1P36542 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ATP5C1P36542 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
ATP5C1P36542 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ATP5C1P36542 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ATP5C1P36542 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ATP5C1P36542 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ATP5C1P36542 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ATP5C1P36542 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ATP5C1P36542 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ATP5C1P36542 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ATP5C1P36542 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ATP5C1P36542 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ATP5C1P36542 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ATP5C1P36542 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ATP5C1P36542 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ATP5C1P36542 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ATP5C1P36542 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.2 ms