Protein–RNA interactions for Protein: P35606

COPB2, Coatomer subunit beta', humanhuman

Predictions only

Length 906 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPB2P35606 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
COPB2P35606 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
COPB2P35606 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
COPB2P35606 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
COPB2P35606 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
COPB2P35606 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
COPB2P35606 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
COPB2P35606 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
COPB2P35606 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
COPB2P35606 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
COPB2P35606 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
COPB2P35606 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
COPB2P35606 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
COPB2P35606 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
COPB2P35606 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
COPB2P35606 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
COPB2P35606 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
COPB2P35606 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
COPB2P35606 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
COPB2P35606 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
COPB2P35606 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
COPB2P35606 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
COPB2P35606 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
COPB2P35606 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
COPB2P35606 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
COPB2P35606 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
COPB2P35606 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
COPB2P35606 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
COPB2P35606 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
COPB2P35606 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
COPB2P35606 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
COPB2P35606 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
COPB2P35606 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
COPB2P35606 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
COPB2P35606 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
COPB2P35606 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
COPB2P35606 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
COPB2P35606 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
COPB2P35606 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
COPB2P35606 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
COPB2P35606 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
COPB2P35606 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
COPB2P35606 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
COPB2P35606 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
COPB2P35606 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
COPB2P35606 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
COPB2P35606 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
COPB2P35606 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
COPB2P35606 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
COPB2P35606 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
COPB2P35606 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
COPB2P35606 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
COPB2P35606 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
COPB2P35606 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
COPB2P35606 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
COPB2P35606 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
COPB2P35606 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
COPB2P35606 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC27.97■■■□□ 2.07
COPB2P35606 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
COPB2P35606 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
COPB2P35606 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
COPB2P35606 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
COPB2P35606 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
COPB2P35606 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
COPB2P35606 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
COPB2P35606 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
COPB2P35606 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
COPB2P35606 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
COPB2P35606 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
COPB2P35606 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
COPB2P35606 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
COPB2P35606 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
COPB2P35606 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
COPB2P35606 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
COPB2P35606 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
COPB2P35606 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
COPB2P35606 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
COPB2P35606 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
COPB2P35606 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
COPB2P35606 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
COPB2P35606 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
COPB2P35606 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
COPB2P35606 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
COPB2P35606 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
COPB2P35606 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
COPB2P35606 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
COPB2P35606 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
COPB2P35606 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
COPB2P35606 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
COPB2P35606 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
COPB2P35606 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC27.91■■■□□ 2.06
COPB2P35606 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
COPB2P35606 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
COPB2P35606 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
COPB2P35606 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
COPB2P35606 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
COPB2P35606 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
COPB2P35606 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
COPB2P35606 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
COPB2P35606 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms