Protein–RNA interactions for Protein: P35527

KRT9, Keratin, type I cytoskeletal 9, humanhuman

Predictions only

Length 623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT9P35527 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
KRT9P35527 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
KRT9P35527 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
KRT9P35527 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
KRT9P35527 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
KRT9P35527 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
KRT9P35527 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
KRT9P35527 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
KRT9P35527 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
KRT9P35527 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
KRT9P35527 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
KRT9P35527 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
KRT9P35527 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
KRT9P35527 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
KRT9P35527 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
KRT9P35527 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
KRT9P35527 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
KRT9P35527 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
KRT9P35527 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
KRT9P35527 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
KRT9P35527 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
KRT9P35527 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
KRT9P35527 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
KRT9P35527 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
KRT9P35527 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
KRT9P35527 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
KRT9P35527 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
KRT9P35527 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
KRT9P35527 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
KRT9P35527 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
KRT9P35527 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
KRT9P35527 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
KRT9P35527 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
KRT9P35527 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
KRT9P35527 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
KRT9P35527 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
KRT9P35527 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
KRT9P35527 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
KRT9P35527 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
KRT9P35527 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
KRT9P35527 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
KRT9P35527 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
KRT9P35527 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
KRT9P35527 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
KRT9P35527 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
KRT9P35527 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
KRT9P35527 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
KRT9P35527 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
KRT9P35527 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
KRT9P35527 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
KRT9P35527 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
KRT9P35527 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
KRT9P35527 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
KRT9P35527 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
KRT9P35527 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
KRT9P35527 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
KRT9P35527 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
KRT9P35527 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
KRT9P35527 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
KRT9P35527 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
KRT9P35527 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
KRT9P35527 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
KRT9P35527 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
KRT9P35527 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
KRT9P35527 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
KRT9P35527 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
KRT9P35527 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
KRT9P35527 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
KRT9P35527 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
KRT9P35527 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
KRT9P35527 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
KRT9P35527 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
KRT9P35527 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
KRT9P35527 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
KRT9P35527 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC26.43■■□□□ 1.82
KRT9P35527 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
KRT9P35527 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
KRT9P35527 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
KRT9P35527 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
KRT9P35527 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
KRT9P35527 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
KRT9P35527 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
KRT9P35527 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
KRT9P35527 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
KRT9P35527 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
KRT9P35527 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
KRT9P35527 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
KRT9P35527 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
KRT9P35527 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
KRT9P35527 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
KRT9P35527 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
KRT9P35527 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
KRT9P35527 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
KRT9P35527 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
KRT9P35527 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
KRT9P35527 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
KRT9P35527 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
KRT9P35527 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
KRT9P35527 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
KRT9P35527 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.7 ms