Protein–RNA interactions for Protein: P35398

RORA, Nuclear receptor ROR-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 523 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RORAP35398 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RORAP35398 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RORAP35398 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RORAP35398 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RORAP35398 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RORAP35398 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RORAP35398 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RORAP35398 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RORAP35398 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RORAP35398 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RORAP35398 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RORAP35398 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
RORAP35398 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RORAP35398 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RORAP35398 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
RORAP35398 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RORAP35398 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RORAP35398 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RORAP35398 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RORAP35398 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RORAP35398 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RORAP35398 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RORAP35398 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RORAP35398 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RORAP35398 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
RORAP35398 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RORAP35398 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RORAP35398 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RORAP35398 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RORAP35398 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RORAP35398 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RORAP35398 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RORAP35398 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RORAP35398 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RORAP35398 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
RORAP35398 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RORAP35398 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RORAP35398 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RORAP35398 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RORAP35398 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RORAP35398 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RORAP35398 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RORAP35398 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RORAP35398 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RORAP35398 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RORAP35398 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RORAP35398 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RORAP35398 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RORAP35398 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RORAP35398 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RORAP35398 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RORAP35398 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
RORAP35398 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RORAP35398 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RORAP35398 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RORAP35398 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
RORAP35398 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.28
RORAP35398 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
RORAP35398 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RORAP35398 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RORAP35398 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RORAP35398 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RORAP35398 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RORAP35398 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RORAP35398 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RORAP35398 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RORAP35398 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
RORAP35398 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
RORAP35398 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RORAP35398 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RORAP35398 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RORAP35398 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RORAP35398 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RORAP35398 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RORAP35398 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
RORAP35398 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RORAP35398 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RORAP35398 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RORAP35398 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RORAP35398 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RORAP35398 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RORAP35398 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RORAP35398 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RORAP35398 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RORAP35398 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RORAP35398 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RORAP35398 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RORAP35398 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RORAP35398 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RORAP35398 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RORAP35398 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RORAP35398 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RORAP35398 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RORAP35398 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RORAP35398 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RORAP35398 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RORAP35398 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RORAP35398 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RORAP35398 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RORAP35398 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms