Protein–RNA interactions for Protein: P35251

RFC1, Replication factor C subunit 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFC1P35251 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
RFC1P35251 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
RFC1P35251 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
RFC1P35251 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
RFC1P35251 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
RFC1P35251 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
RFC1P35251 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
RFC1P35251 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
RFC1P35251 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
RFC1P35251 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
RFC1P35251 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
RFC1P35251 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
RFC1P35251 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
RFC1P35251 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
RFC1P35251 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
RFC1P35251 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
RFC1P35251 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RFC1P35251 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
RFC1P35251 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RFC1P35251 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
RFC1P35251 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RFC1P35251 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
RFC1P35251 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RFC1P35251 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RFC1P35251 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
RFC1P35251 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RFC1P35251 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
RFC1P35251 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
RFC1P35251 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
RFC1P35251 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RFC1P35251 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
RFC1P35251 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RFC1P35251 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
RFC1P35251 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
RFC1P35251 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RFC1P35251 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RFC1P35251 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RFC1P35251 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RFC1P35251 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RFC1P35251 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
RFC1P35251 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
RFC1P35251 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RFC1P35251 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RFC1P35251 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RFC1P35251 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
RFC1P35251 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RFC1P35251 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
RFC1P35251 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
RFC1P35251 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
RFC1P35251 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
RFC1P35251 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
RFC1P35251 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
RFC1P35251 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
RFC1P35251 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
RFC1P35251 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
RFC1P35251 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RFC1P35251 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
RFC1P35251 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
RFC1P35251 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RFC1P35251 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
RFC1P35251 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RFC1P35251 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RFC1P35251 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
RFC1P35251 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
RFC1P35251 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
RFC1P35251 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RFC1P35251 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RFC1P35251 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
RFC1P35251 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RFC1P35251 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RFC1P35251 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
RFC1P35251 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RFC1P35251 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
RFC1P35251 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RFC1P35251 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RFC1P35251 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
RFC1P35251 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RFC1P35251 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RFC1P35251 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RFC1P35251 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RFC1P35251 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RFC1P35251 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
RFC1P35251 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
RFC1P35251 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RFC1P35251 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
RFC1P35251 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
RFC1P35251 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
RFC1P35251 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC25.5■■□□□ 1.67
RFC1P35251 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RFC1P35251 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
RFC1P35251 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
RFC1P35251 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RFC1P35251 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
RFC1P35251 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RFC1P35251 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RFC1P35251 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
RFC1P35251 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RFC1P35251 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RFC1P35251 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RFC1P35251 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms