Protein–RNA interactions for Protein: P35052

GPC1, Glypican-1, humanhuman

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC1P35052 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GPC1P35052 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GPC1P35052 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GPC1P35052 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GPC1P35052 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GPC1P35052 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GPC1P35052 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GPC1P35052 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GPC1P35052 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GPC1P35052 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GPC1P35052 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GPC1P35052 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GPC1P35052 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GPC1P35052 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GPC1P35052 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GPC1P35052 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GPC1P35052 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
GPC1P35052 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GPC1P35052 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GPC1P35052 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GPC1P35052 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GPC1P35052 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GPC1P35052 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GPC1P35052 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GPC1P35052 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GPC1P35052 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GPC1P35052 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GPC1P35052 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GPC1P35052 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GPC1P35052 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
GPC1P35052 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GPC1P35052 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GPC1P35052 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GPC1P35052 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GPC1P35052 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GPC1P35052 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GPC1P35052 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GPC1P35052 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GPC1P35052 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GPC1P35052 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GPC1P35052 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GPC1P35052 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GPC1P35052 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GPC1P35052 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GPC1P35052 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GPC1P35052 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GPC1P35052 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GPC1P35052 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GPC1P35052 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GPC1P35052 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GPC1P35052 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
GPC1P35052 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GPC1P35052 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GPC1P35052 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GPC1P35052 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GPC1P35052 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GPC1P35052 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GPC1P35052 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GPC1P35052 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GPC1P35052 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GPC1P35052 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GPC1P35052 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GPC1P35052 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GPC1P35052 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GPC1P35052 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GPC1P35052 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GPC1P35052 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GPC1P35052 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
GPC1P35052 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GPC1P35052 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
GPC1P35052 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GPC1P35052 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GPC1P35052 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GPC1P35052 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
GPC1P35052 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
GPC1P35052 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
GPC1P35052 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GPC1P35052 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GPC1P35052 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GPC1P35052 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GPC1P35052 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GPC1P35052 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GPC1P35052 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GPC1P35052 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GPC1P35052 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GPC1P35052 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GPC1P35052 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GPC1P35052 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GPC1P35052 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GPC1P35052 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GPC1P35052 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GPC1P35052 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GPC1P35052 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GPC1P35052 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GPC1P35052 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GPC1P35052 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GPC1P35052 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GPC1P35052 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GPC1P35052 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GPC1P35052 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.8 ms