Protein–RNA interactions for Protein: P34925

RYK, Tyrosine-protein kinase RYK, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RYKP34925 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RYKP34925 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
RYKP34925 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
RYKP34925 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RYKP34925 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RYKP34925 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RYKP34925 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RYKP34925 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RYKP34925 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RYKP34925 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
RYKP34925 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RYKP34925 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RYKP34925 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
RYKP34925 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RYKP34925 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RYKP34925 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RYKP34925 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
RYKP34925 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RYKP34925 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RYKP34925 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RYKP34925 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RYKP34925 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RYKP34925 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RYKP34925 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RYKP34925 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RYKP34925 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RYKP34925 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RYKP34925 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RYKP34925 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
RYKP34925 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RYKP34925 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RYKP34925 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
RYKP34925 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RYKP34925 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
RYKP34925 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RYKP34925 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RYKP34925 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RYKP34925 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RYKP34925 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RYKP34925 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RYKP34925 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RYKP34925 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RYKP34925 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RYKP34925 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RYKP34925 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RYKP34925 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RYKP34925 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RYKP34925 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RYKP34925 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
RYKP34925 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RYKP34925 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RYKP34925 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RYKP34925 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RYKP34925 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RYKP34925 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
RYKP34925 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RYKP34925 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RYKP34925 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RYKP34925 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RYKP34925 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RYKP34925 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
RYKP34925 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RYKP34925 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RYKP34925 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RYKP34925 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RYKP34925 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RYKP34925 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RYKP34925 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RYKP34925 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RYKP34925 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RYKP34925 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RYKP34925 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RYKP34925 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
RYKP34925 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
RYKP34925 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RYKP34925 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RYKP34925 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RYKP34925 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RYKP34925 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RYKP34925 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RYKP34925 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RYKP34925 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RYKP34925 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RYKP34925 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RYKP34925 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RYKP34925 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
RYKP34925 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RYKP34925 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RYKP34925 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RYKP34925 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RYKP34925 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RYKP34925 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RYKP34925 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RYKP34925 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RYKP34925 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RYKP34925 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RYKP34925 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RYKP34925 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RYKP34925 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RYKP34925 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms