Protein–RNA interactions for Protein: P34925

RYK, Tyrosine-protein kinase RYK, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RYKP34925 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RYKP34925 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
RYKP34925 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
RYKP34925 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RYKP34925 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RYKP34925 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RYKP34925 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RYKP34925 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RYKP34925 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RYKP34925 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
RYKP34925 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RYKP34925 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RYKP34925 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
RYKP34925 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RYKP34925 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RYKP34925 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RYKP34925 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
RYKP34925 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RYKP34925 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RYKP34925 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RYKP34925 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RYKP34925 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RYKP34925 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RYKP34925 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RYKP34925 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RYKP34925 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RYKP34925 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RYKP34925 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RYKP34925 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
RYKP34925 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RYKP34925 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RYKP34925 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
RYKP34925 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RYKP34925 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
RYKP34925 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RYKP34925 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RYKP34925 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RYKP34925 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RYKP34925 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RYKP34925 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RYKP34925 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RYKP34925 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RYKP34925 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RYKP34925 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RYKP34925 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RYKP34925 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RYKP34925 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RYKP34925 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RYKP34925 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
RYKP34925 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RYKP34925 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RYKP34925 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RYKP34925 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RYKP34925 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RYKP34925 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
RYKP34925 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RYKP34925 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RYKP34925 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RYKP34925 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RYKP34925 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RYKP34925 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
RYKP34925 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RYKP34925 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RYKP34925 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RYKP34925 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RYKP34925 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RYKP34925 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RYKP34925 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RYKP34925 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RYKP34925 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RYKP34925 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RYKP34925 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RYKP34925 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
RYKP34925 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
RYKP34925 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RYKP34925 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RYKP34925 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RYKP34925 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RYKP34925 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RYKP34925 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RYKP34925 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RYKP34925 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RYKP34925 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RYKP34925 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RYKP34925 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RYKP34925 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
RYKP34925 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RYKP34925 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RYKP34925 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RYKP34925 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RYKP34925 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RYKP34925 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RYKP34925 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RYKP34925 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RYKP34925 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RYKP34925 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RYKP34925 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RYKP34925 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RYKP34925 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RYKP34925 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms