Protein–RNA interactions for Protein: P33261

CYP2C19, Cytochrome P450 2C19, humanhuman

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP2C19P33261 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CYP2C19P33261 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CYP2C19P33261 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CYP2C19P33261 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CYP2C19P33261 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CYP2C19P33261 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
CYP2C19P33261 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CYP2C19P33261 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CYP2C19P33261 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CYP2C19P33261 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CYP2C19P33261 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CYP2C19P33261 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CYP2C19P33261 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CYP2C19P33261 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CYP2C19P33261 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CYP2C19P33261 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CYP2C19P33261 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CYP2C19P33261 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CYP2C19P33261 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CYP2C19P33261 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
CYP2C19P33261 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CYP2C19P33261 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CYP2C19P33261 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CYP2C19P33261 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CYP2C19P33261 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
CYP2C19P33261 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CYP2C19P33261 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CYP2C19P33261 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CYP2C19P33261 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
CYP2C19P33261 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
CYP2C19P33261 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CYP2C19P33261 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CYP2C19P33261 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
CYP2C19P33261 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CYP2C19P33261 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CYP2C19P33261 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CYP2C19P33261 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CYP2C19P33261 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
CYP2C19P33261 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CYP2C19P33261 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CYP2C19P33261 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CYP2C19P33261 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CYP2C19P33261 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CYP2C19P33261 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
CYP2C19P33261 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CYP2C19P33261 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CYP2C19P33261 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CYP2C19P33261 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CYP2C19P33261 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CYP2C19P33261 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CYP2C19P33261 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CYP2C19P33261 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CYP2C19P33261 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
CYP2C19P33261 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CYP2C19P33261 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CYP2C19P33261 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CYP2C19P33261 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CYP2C19P33261 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CYP2C19P33261 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CYP2C19P33261 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CYP2C19P33261 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CYP2C19P33261 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CYP2C19P33261 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CYP2C19P33261 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CYP2C19P33261 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CYP2C19P33261 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CYP2C19P33261 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CYP2C19P33261 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CYP2C19P33261 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CYP2C19P33261 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
CYP2C19P33261 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
CYP2C19P33261 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CYP2C19P33261 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CYP2C19P33261 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CYP2C19P33261 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CYP2C19P33261 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CYP2C19P33261 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
CYP2C19P33261 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CYP2C19P33261 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CYP2C19P33261 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
CYP2C19P33261 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CYP2C19P33261 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CYP2C19P33261 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CYP2C19P33261 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CYP2C19P33261 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CYP2C19P33261 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CYP2C19P33261 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CYP2C19P33261 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CYP2C19P33261 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CYP2C19P33261 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CYP2C19P33261 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CYP2C19P33261 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CYP2C19P33261 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CYP2C19P33261 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CYP2C19P33261 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CYP2C19P33261 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CYP2C19P33261 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CYP2C19P33261 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CYP2C19P33261 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CYP2C19P33261 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms