Protein–RNA interactions for Protein: P33121

ACSL1, Long-chain-fatty-acid--CoA ligase 1, humanhuman

Predictions only

Length 698 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACSL1P33121 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ACSL1P33121 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ACSL1P33121 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ACSL1P33121 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ACSL1P33121 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ACSL1P33121 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ACSL1P33121 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ACSL1P33121 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
ACSL1P33121 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ACSL1P33121 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ACSL1P33121 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ACSL1P33121 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ACSL1P33121 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ACSL1P33121 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ACSL1P33121 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ACSL1P33121 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ACSL1P33121 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ACSL1P33121 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ACSL1P33121 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ACSL1P33121 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ACSL1P33121 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ACSL1P33121 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
ACSL1P33121 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ACSL1P33121 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ACSL1P33121 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ACSL1P33121 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ACSL1P33121 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ACSL1P33121 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ACSL1P33121 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ACSL1P33121 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ACSL1P33121 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ACSL1P33121 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ACSL1P33121 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ACSL1P33121 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ACSL1P33121 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ACSL1P33121 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ACSL1P33121 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ACSL1P33121 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ACSL1P33121 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ACSL1P33121 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ACSL1P33121 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ACSL1P33121 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ACSL1P33121 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ACSL1P33121 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
ACSL1P33121 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ACSL1P33121 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
ACSL1P33121 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
ACSL1P33121 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ACSL1P33121 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ACSL1P33121 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ACSL1P33121 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ACSL1P33121 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ACSL1P33121 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ACSL1P33121 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ACSL1P33121 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ACSL1P33121 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ACSL1P33121 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ACSL1P33121 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ACSL1P33121 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ACSL1P33121 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ACSL1P33121 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ACSL1P33121 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ACSL1P33121 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ACSL1P33121 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ACSL1P33121 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ACSL1P33121 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ACSL1P33121 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ACSL1P33121 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ACSL1P33121 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ACSL1P33121 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ACSL1P33121 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ACSL1P33121 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ACSL1P33121 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ACSL1P33121 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ACSL1P33121 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ACSL1P33121 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ACSL1P33121 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ACSL1P33121 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ACSL1P33121 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ACSL1P33121 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ACSL1P33121 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ACSL1P33121 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ACSL1P33121 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ACSL1P33121 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ACSL1P33121 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ACSL1P33121 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ACSL1P33121 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
ACSL1P33121 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ACSL1P33121 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ACSL1P33121 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ACSL1P33121 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ACSL1P33121 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ACSL1P33121 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ACSL1P33121 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
ACSL1P33121 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
ACSL1P33121 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
ACSL1P33121 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ACSL1P33121 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ACSL1P33121 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ACSL1P33121 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms