Protein–RNA interactions for Protein: P29558

RBMS1, RNA-binding motif, single-stranded-interacting protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBMS1P29558 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RBMS1P29558 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RBMS1P29558 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RBMS1P29558 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RBMS1P29558 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RBMS1P29558 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RBMS1P29558 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RBMS1P29558 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RBMS1P29558 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RBMS1P29558 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RBMS1P29558 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RBMS1P29558 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RBMS1P29558 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RBMS1P29558 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RBMS1P29558 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RBMS1P29558 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RBMS1P29558 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RBMS1P29558 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RBMS1P29558 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
RBMS1P29558 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RBMS1P29558 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RBMS1P29558 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RBMS1P29558 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RBMS1P29558 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RBMS1P29558 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RBMS1P29558 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RBMS1P29558 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RBMS1P29558 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RBMS1P29558 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RBMS1P29558 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RBMS1P29558 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
RBMS1P29558 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RBMS1P29558 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RBMS1P29558 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RBMS1P29558 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RBMS1P29558 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RBMS1P29558 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RBMS1P29558 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RBMS1P29558 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RBMS1P29558 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
RBMS1P29558 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RBMS1P29558 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RBMS1P29558 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RBMS1P29558 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RBMS1P29558 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RBMS1P29558 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RBMS1P29558 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RBMS1P29558 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RBMS1P29558 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
RBMS1P29558 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RBMS1P29558 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RBMS1P29558 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RBMS1P29558 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RBMS1P29558 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RBMS1P29558 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RBMS1P29558 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RBMS1P29558 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RBMS1P29558 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RBMS1P29558 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RBMS1P29558 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RBMS1P29558 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RBMS1P29558 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RBMS1P29558 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RBMS1P29558 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RBMS1P29558 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RBMS1P29558 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RBMS1P29558 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RBMS1P29558 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
RBMS1P29558 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RBMS1P29558 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RBMS1P29558 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RBMS1P29558 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RBMS1P29558 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RBMS1P29558 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RBMS1P29558 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RBMS1P29558 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RBMS1P29558 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
RBMS1P29558 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
RBMS1P29558 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RBMS1P29558 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RBMS1P29558 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
RBMS1P29558 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RBMS1P29558 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RBMS1P29558 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RBMS1P29558 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RBMS1P29558 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
RBMS1P29558 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RBMS1P29558 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RBMS1P29558 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RBMS1P29558 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RBMS1P29558 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RBMS1P29558 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RBMS1P29558 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RBMS1P29558 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RBMS1P29558 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RBMS1P29558 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RBMS1P29558 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RBMS1P29558 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RBMS1P29558 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RBMS1P29558 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms