Protein–RNA interactions for Protein: P29536

LMOD1, Leiomodin-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 600 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMOD1P29536 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC29.89■■■□□ 2.38
LMOD1P29536 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
LMOD1P29536 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
LMOD1P29536 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC29.88■■■□□ 2.37
LMOD1P29536 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
LMOD1P29536 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
LMOD1P29536 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
LMOD1P29536 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC29.87■■■□□ 2.37
LMOD1P29536 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC29.87■■■□□ 2.37
LMOD1P29536 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
LMOD1P29536 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
LMOD1P29536 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
LMOD1P29536 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
LMOD1P29536 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
LMOD1P29536 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
LMOD1P29536 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
LMOD1P29536 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
LMOD1P29536 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
LMOD1P29536 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
LMOD1P29536 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
LMOD1P29536 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
LMOD1P29536 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
LMOD1P29536 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
LMOD1P29536 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
LMOD1P29536 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
LMOD1P29536 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
LMOD1P29536 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
LMOD1P29536 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
LMOD1P29536 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
LMOD1P29536 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.37
LMOD1P29536 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
LMOD1P29536 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
LMOD1P29536 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
LMOD1P29536 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
LMOD1P29536 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
LMOD1P29536 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
LMOD1P29536 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
LMOD1P29536 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
LMOD1P29536 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
LMOD1P29536 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
LMOD1P29536 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
LMOD1P29536 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
LMOD1P29536 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
LMOD1P29536 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC29.8■■■□□ 2.36
LMOD1P29536 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
LMOD1P29536 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
LMOD1P29536 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
LMOD1P29536 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
LMOD1P29536 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
LMOD1P29536 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC29.78■■■□□ 2.36
LMOD1P29536 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
LMOD1P29536 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
LMOD1P29536 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
LMOD1P29536 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
LMOD1P29536 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
LMOD1P29536 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
LMOD1P29536 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC29.77■■■□□ 2.36
LMOD1P29536 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
LMOD1P29536 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC29.77■■■□□ 2.36
LMOD1P29536 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
LMOD1P29536 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
LMOD1P29536 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
LMOD1P29536 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
LMOD1P29536 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
LMOD1P29536 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
LMOD1P29536 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
LMOD1P29536 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
LMOD1P29536 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
LMOD1P29536 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
LMOD1P29536 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
LMOD1P29536 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
LMOD1P29536 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
LMOD1P29536 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
LMOD1P29536 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
LMOD1P29536 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC29.71■■■□□ 2.35
LMOD1P29536 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
LMOD1P29536 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
LMOD1P29536 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
LMOD1P29536 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
LMOD1P29536 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.35
LMOD1P29536 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC29.7■■■□□ 2.35
LMOD1P29536 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
LMOD1P29536 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC29.7■■■□□ 2.35
LMOD1P29536 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
LMOD1P29536 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
LMOD1P29536 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
LMOD1P29536 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
LMOD1P29536 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
LMOD1P29536 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
LMOD1P29536 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
LMOD1P29536 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
LMOD1P29536 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
LMOD1P29536 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
LMOD1P29536 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
LMOD1P29536 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
LMOD1P29536 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
LMOD1P29536 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
LMOD1P29536 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.66■■■□□ 2.34
LMOD1P29536 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC29.66■■■□□ 2.34
LMOD1P29536 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.9 ms