Protein–RNA interactions for Protein: P29122

PCSK6, Proprotein convertase subtilisin/kexin type 6, humanhuman

Predictions only

Length 969 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCSK6P29122 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PCSK6P29122 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PCSK6P29122 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PCSK6P29122 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PCSK6P29122 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PCSK6P29122 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PCSK6P29122 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PCSK6P29122 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PCSK6P29122 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PCSK6P29122 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PCSK6P29122 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PCSK6P29122 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PCSK6P29122 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PCSK6P29122 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PCSK6P29122 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PCSK6P29122 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PCSK6P29122 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PCSK6P29122 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
PCSK6P29122 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PCSK6P29122 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PCSK6P29122 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PCSK6P29122 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PCSK6P29122 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PCSK6P29122 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PCSK6P29122 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PCSK6P29122 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PCSK6P29122 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PCSK6P29122 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PCSK6P29122 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PCSK6P29122 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PCSK6P29122 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PCSK6P29122 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PCSK6P29122 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PCSK6P29122 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PCSK6P29122 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PCSK6P29122 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PCSK6P29122 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PCSK6P29122 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PCSK6P29122 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
PCSK6P29122 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PCSK6P29122 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PCSK6P29122 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PCSK6P29122 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PCSK6P29122 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PCSK6P29122 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PCSK6P29122 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PCSK6P29122 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PCSK6P29122 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PCSK6P29122 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PCSK6P29122 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PCSK6P29122 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PCSK6P29122 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
PCSK6P29122 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
PCSK6P29122 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PCSK6P29122 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PCSK6P29122 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
PCSK6P29122 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PCSK6P29122 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PCSK6P29122 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PCSK6P29122 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PCSK6P29122 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PCSK6P29122 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
PCSK6P29122 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PCSK6P29122 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PCSK6P29122 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PCSK6P29122 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PCSK6P29122 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PCSK6P29122 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PCSK6P29122 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PCSK6P29122 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PCSK6P29122 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PCSK6P29122 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PCSK6P29122 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PCSK6P29122 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PCSK6P29122 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
PCSK6P29122 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PCSK6P29122 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PCSK6P29122 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PCSK6P29122 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PCSK6P29122 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PCSK6P29122 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PCSK6P29122 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PCSK6P29122 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PCSK6P29122 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PCSK6P29122 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PCSK6P29122 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PCSK6P29122 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PCSK6P29122 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PCSK6P29122 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PCSK6P29122 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PCSK6P29122 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PCSK6P29122 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PCSK6P29122 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PCSK6P29122 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PCSK6P29122 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PCSK6P29122 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PCSK6P29122 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PCSK6P29122 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PCSK6P29122 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PCSK6P29122 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms