Protein–RNA interactions for Protein: P28222

HTR1B, 5-hydroxytryptamine receptor 1B, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTR1BP28222 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
HTR1BP28222 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
HTR1BP28222 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
HTR1BP28222 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
HTR1BP28222 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HTR1BP28222 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HTR1BP28222 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HTR1BP28222 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
HTR1BP28222 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HTR1BP28222 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
HTR1BP28222 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
HTR1BP28222 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
HTR1BP28222 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
HTR1BP28222 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
HTR1BP28222 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
HTR1BP28222 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HTR1BP28222 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HTR1BP28222 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
HTR1BP28222 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HTR1BP28222 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HTR1BP28222 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HTR1BP28222 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
HTR1BP28222 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
HTR1BP28222 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HTR1BP28222 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HTR1BP28222 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HTR1BP28222 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HTR1BP28222 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
HTR1BP28222 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HTR1BP28222 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HTR1BP28222 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HTR1BP28222 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HTR1BP28222 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HTR1BP28222 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
HTR1BP28222 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
HTR1BP28222 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
HTR1BP28222 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
HTR1BP28222 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
HTR1BP28222 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HTR1BP28222 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HTR1BP28222 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HTR1BP28222 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HTR1BP28222 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HTR1BP28222 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
HTR1BP28222 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
HTR1BP28222 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
HTR1BP28222 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HTR1BP28222 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
HTR1BP28222 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HTR1BP28222 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HTR1BP28222 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
HTR1BP28222 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HTR1BP28222 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HTR1BP28222 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HTR1BP28222 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
HTR1BP28222 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HTR1BP28222 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HTR1BP28222 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
HTR1BP28222 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
HTR1BP28222 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
HTR1BP28222 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
HTR1BP28222 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
HTR1BP28222 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
HTR1BP28222 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
HTR1BP28222 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HTR1BP28222 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
HTR1BP28222 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
HTR1BP28222 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HTR1BP28222 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HTR1BP28222 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HTR1BP28222 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
HTR1BP28222 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
HTR1BP28222 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
HTR1BP28222 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HTR1BP28222 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HTR1BP28222 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HTR1BP28222 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
HTR1BP28222 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
HTR1BP28222 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
HTR1BP28222 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HTR1BP28222 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HTR1BP28222 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HTR1BP28222 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HTR1BP28222 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HTR1BP28222 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HTR1BP28222 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HTR1BP28222 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HTR1BP28222 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HTR1BP28222 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HTR1BP28222 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HTR1BP28222 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
HTR1BP28222 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
HTR1BP28222 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
HTR1BP28222 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HTR1BP28222 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HTR1BP28222 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HTR1BP28222 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
HTR1BP28222 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
HTR1BP28222 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
HTR1BP28222 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms