Protein–RNA interactions for Protein: P27815

PDE4A, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4A, humanhuman

Predictions only

Length 886 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4AP27815 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
PDE4AP27815 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
PDE4AP27815 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
PDE4AP27815 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
PDE4AP27815 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
PDE4AP27815 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
PDE4AP27815 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
PDE4AP27815 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC30.53■■■□□ 2.48
PDE4AP27815 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
PDE4AP27815 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
PDE4AP27815 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
PDE4AP27815 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.52■■■□□ 2.48
PDE4AP27815 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
PDE4AP27815 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
PDE4AP27815 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
PDE4AP27815 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC30.52■■■□□ 2.48
PDE4AP27815 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
PDE4AP27815 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
PDE4AP27815 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
PDE4AP27815 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.51■■■□□ 2.47
PDE4AP27815 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
PDE4AP27815 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
PDE4AP27815 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC30.5■■■□□ 2.47
PDE4AP27815 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
PDE4AP27815 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
PDE4AP27815 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC30.49■■■□□ 2.47
PDE4AP27815 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
PDE4AP27815 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC30.49■■■□□ 2.47
PDE4AP27815 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
PDE4AP27815 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
PDE4AP27815 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC30.48■■■□□ 2.47
PDE4AP27815 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
PDE4AP27815 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC30.48■■■□□ 2.47
PDE4AP27815 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC30.48■■■□□ 2.47
PDE4AP27815 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
PDE4AP27815 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
PDE4AP27815 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.48■■■□□ 2.47
PDE4AP27815 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
PDE4AP27815 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
PDE4AP27815 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
PDE4AP27815 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
PDE4AP27815 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
PDE4AP27815 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
PDE4AP27815 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.46■■■□□ 2.47
PDE4AP27815 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.46■■■□□ 2.47
PDE4AP27815 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC30.46■■■□□ 2.47
PDE4AP27815 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
PDE4AP27815 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC30.46■■■□□ 2.47
PDE4AP27815 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
PDE4AP27815 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
PDE4AP27815 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
PDE4AP27815 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.45■■■□□ 2.47
PDE4AP27815 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC30.45■■■□□ 2.47
PDE4AP27815 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.45■■■□□ 2.46
PDE4AP27815 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.45■■■□□ 2.46
PDE4AP27815 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
PDE4AP27815 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
PDE4AP27815 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
PDE4AP27815 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC30.44■■■□□ 2.46
PDE4AP27815 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC30.44■■■□□ 2.46
PDE4AP27815 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
PDE4AP27815 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
PDE4AP27815 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
PDE4AP27815 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC30.43■■■□□ 2.46
PDE4AP27815 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC30.43■■■□□ 2.46
PDE4AP27815 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
PDE4AP27815 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.43■■■□□ 2.46
PDE4AP27815 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
PDE4AP27815 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
PDE4AP27815 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
PDE4AP27815 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC30.42■■■□□ 2.46
PDE4AP27815 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC30.42■■■□□ 2.46
PDE4AP27815 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC30.41■■■□□ 2.46
PDE4AP27815 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
PDE4AP27815 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
PDE4AP27815 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
PDE4AP27815 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
PDE4AP27815 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
PDE4AP27815 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC30.4■■■□□ 2.46
PDE4AP27815 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
PDE4AP27815 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
PDE4AP27815 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
PDE4AP27815 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
PDE4AP27815 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
PDE4AP27815 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
PDE4AP27815 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
PDE4AP27815 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.39■■■□□ 2.45
PDE4AP27815 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
PDE4AP27815 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC30.38■■■□□ 2.45
PDE4AP27815 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC30.38■■■□□ 2.45
PDE4AP27815 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC30.38■■■□□ 2.45
PDE4AP27815 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
PDE4AP27815 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
PDE4AP27815 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
PDE4AP27815 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.38■■■□□ 2.45
PDE4AP27815 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC30.38■■■□□ 2.45
PDE4AP27815 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC30.38■■■□□ 2.45
PDE4AP27815 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
PDE4AP27815 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
PDE4AP27815 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.9 ms