Protein–RNA interactions for Protein: P27539

GDF1, Embryonic growth/differentiation factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDF1P27539 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
GDF1P27539 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GDF1P27539 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GDF1P27539 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GDF1P27539 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GDF1P27539 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GDF1P27539 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GDF1P27539 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GDF1P27539 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GDF1P27539 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GDF1P27539 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GDF1P27539 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
GDF1P27539 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GDF1P27539 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GDF1P27539 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GDF1P27539 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GDF1P27539 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GDF1P27539 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GDF1P27539 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GDF1P27539 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GDF1P27539 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GDF1P27539 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GDF1P27539 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GDF1P27539 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GDF1P27539 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GDF1P27539 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GDF1P27539 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GDF1P27539 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GDF1P27539 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GDF1P27539 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GDF1P27539 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GDF1P27539 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GDF1P27539 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GDF1P27539 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GDF1P27539 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GDF1P27539 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GDF1P27539 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GDF1P27539 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GDF1P27539 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GDF1P27539 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GDF1P27539 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GDF1P27539 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GDF1P27539 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
GDF1P27539 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GDF1P27539 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GDF1P27539 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GDF1P27539 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GDF1P27539 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
GDF1P27539 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GDF1P27539 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GDF1P27539 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
GDF1P27539 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
GDF1P27539 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GDF1P27539 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GDF1P27539 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GDF1P27539 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GDF1P27539 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GDF1P27539 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GDF1P27539 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GDF1P27539 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GDF1P27539 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
GDF1P27539 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GDF1P27539 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GDF1P27539 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GDF1P27539 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GDF1P27539 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GDF1P27539 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GDF1P27539 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GDF1P27539 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GDF1P27539 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GDF1P27539 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GDF1P27539 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GDF1P27539 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GDF1P27539 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GDF1P27539 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GDF1P27539 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GDF1P27539 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GDF1P27539 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GDF1P27539 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GDF1P27539 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GDF1P27539 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GDF1P27539 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GDF1P27539 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GDF1P27539 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GDF1P27539 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GDF1P27539 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GDF1P27539 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GDF1P27539 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GDF1P27539 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GDF1P27539 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GDF1P27539 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GDF1P27539 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GDF1P27539 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
GDF1P27539 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GDF1P27539 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GDF1P27539 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GDF1P27539 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GDF1P27539 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
GDF1P27539 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
GDF1P27539 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.2 ms