Protein–RNA interactions for Protein: P23378

GLDC, Glycine dehydrogenase (decarboxylating), mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 1,020 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLDCP23378 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
GLDCP23378 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
GLDCP23378 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
GLDCP23378 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
GLDCP23378 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
GLDCP23378 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
GLDCP23378 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
GLDCP23378 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GLDCP23378 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GLDCP23378 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
GLDCP23378 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
GLDCP23378 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
GLDCP23378 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GLDCP23378 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
GLDCP23378 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC25■■□□□ 1.59
GLDCP23378 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GLDCP23378 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GLDCP23378 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
GLDCP23378 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
GLDCP23378 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
GLDCP23378 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
GLDCP23378 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
GLDCP23378 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GLDCP23378 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.98■■□□□ 1.59
GLDCP23378 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
GLDCP23378 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GLDCP23378 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GLDCP23378 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GLDCP23378 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GLDCP23378 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GLDCP23378 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GLDCP23378 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GLDCP23378 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GLDCP23378 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
GLDCP23378 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
GLDCP23378 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
GLDCP23378 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GLDCP23378 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GLDCP23378 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
GLDCP23378 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GLDCP23378 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GLDCP23378 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
GLDCP23378 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
GLDCP23378 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
GLDCP23378 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
GLDCP23378 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
GLDCP23378 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
GLDCP23378 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
GLDCP23378 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
GLDCP23378 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
GLDCP23378 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
GLDCP23378 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
GLDCP23378 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
GLDCP23378 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
GLDCP23378 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
GLDCP23378 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
GLDCP23378 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
GLDCP23378 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
GLDCP23378 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
GLDCP23378 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
GLDCP23378 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GLDCP23378 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
GLDCP23378 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
GLDCP23378 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GLDCP23378 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GLDCP23378 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
GLDCP23378 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
GLDCP23378 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
GLDCP23378 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
GLDCP23378 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
GLDCP23378 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
GLDCP23378 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
GLDCP23378 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
GLDCP23378 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GLDCP23378 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
GLDCP23378 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GLDCP23378 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24.9■■□□□ 1.58
GLDCP23378 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GLDCP23378 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
GLDCP23378 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
GLDCP23378 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
GLDCP23378 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
GLDCP23378 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GLDCP23378 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GLDCP23378 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GLDCP23378 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GLDCP23378 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
GLDCP23378 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
GLDCP23378 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
GLDCP23378 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
GLDCP23378 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
GLDCP23378 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
GLDCP23378 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
GLDCP23378 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
GLDCP23378 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
GLDCP23378 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC24.86■■□□□ 1.57
GLDCP23378 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
GLDCP23378 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
GLDCP23378 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GLDCP23378 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms