Protein–RNA interactions for Protein: P23219

PTGS1, Prostaglandin G/H synthase 1, humanhuman

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGS1P23219 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PTGS1P23219 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
PTGS1P23219 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
PTGS1P23219 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
PTGS1P23219 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PTGS1P23219 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PTGS1P23219 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PTGS1P23219 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PTGS1P23219 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
PTGS1P23219 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
PTGS1P23219 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PTGS1P23219 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
PTGS1P23219 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PTGS1P23219 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
PTGS1P23219 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PTGS1P23219 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
PTGS1P23219 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
PTGS1P23219 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
PTGS1P23219 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC28.27■■■□□ 2.12
PTGS1P23219 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
PTGS1P23219 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
PTGS1P23219 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
PTGS1P23219 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
PTGS1P23219 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
PTGS1P23219 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
PTGS1P23219 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
PTGS1P23219 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PTGS1P23219 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PTGS1P23219 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
PTGS1P23219 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PTGS1P23219 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PTGS1P23219 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PTGS1P23219 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
PTGS1P23219 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PTGS1P23219 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PTGS1P23219 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PTGS1P23219 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
PTGS1P23219 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
PTGS1P23219 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
PTGS1P23219 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
PTGS1P23219 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PTGS1P23219 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PTGS1P23219 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
PTGS1P23219 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
PTGS1P23219 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
PTGS1P23219 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
PTGS1P23219 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
PTGS1P23219 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC28.2■■■□□ 2.1
PTGS1P23219 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
PTGS1P23219 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
PTGS1P23219 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
PTGS1P23219 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
PTGS1P23219 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
PTGS1P23219 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
PTGS1P23219 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PTGS1P23219 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PTGS1P23219 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
PTGS1P23219 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PTGS1P23219 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
PTGS1P23219 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PTGS1P23219 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
PTGS1P23219 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PTGS1P23219 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
PTGS1P23219 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PTGS1P23219 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PTGS1P23219 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC28.18■■■□□ 2.1
PTGS1P23219 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
PTGS1P23219 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PTGS1P23219 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
PTGS1P23219 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
PTGS1P23219 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
PTGS1P23219 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PTGS1P23219 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PTGS1P23219 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PTGS1P23219 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PTGS1P23219 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PTGS1P23219 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
PTGS1P23219 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PTGS1P23219 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PTGS1P23219 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PTGS1P23219 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
PTGS1P23219 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
PTGS1P23219 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
PTGS1P23219 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
PTGS1P23219 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
PTGS1P23219 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PTGS1P23219 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PTGS1P23219 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PTGS1P23219 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PTGS1P23219 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
PTGS1P23219 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
PTGS1P23219 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
PTGS1P23219 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
PTGS1P23219 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
PTGS1P23219 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PTGS1P23219 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PTGS1P23219 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PTGS1P23219 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PTGS1P23219 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
PTGS1P23219 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.9 ms