Protein–RNA interactions for Protein: P20036

HLA-DPA1, HLA class II histocompatibility antigen, DP alpha 1 chain, humanhuman

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DPA1P20036 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
HLA-DPA1P20036 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
HLA-DPA1P20036 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
HLA-DPA1P20036 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
HLA-DPA1P20036 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
HLA-DPA1P20036 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
HLA-DPA1P20036 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
HLA-DPA1P20036 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
HLA-DPA1P20036 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
HLA-DPA1P20036 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
HLA-DPA1P20036 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
HLA-DPA1P20036 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
HLA-DPA1P20036 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HLA-DPA1P20036 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
HLA-DPA1P20036 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HLA-DPA1P20036 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
HLA-DPA1P20036 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
HLA-DPA1P20036 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
HLA-DPA1P20036 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
HLA-DPA1P20036 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HLA-DPA1P20036 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HLA-DPA1P20036 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HLA-DPA1P20036 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
HLA-DPA1P20036 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
HLA-DPA1P20036 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
HLA-DPA1P20036 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
HLA-DPA1P20036 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
HLA-DPA1P20036 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
HLA-DPA1P20036 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
HLA-DPA1P20036 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
HLA-DPA1P20036 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
HLA-DPA1P20036 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
HLA-DPA1P20036 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
HLA-DPA1P20036 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
HLA-DPA1P20036 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
HLA-DPA1P20036 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
HLA-DPA1P20036 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
HLA-DPA1P20036 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
HLA-DPA1P20036 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
HLA-DPA1P20036 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.56■■□□□ 1.52
HLA-DPA1P20036 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
HLA-DPA1P20036 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
HLA-DPA1P20036 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
HLA-DPA1P20036 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
HLA-DPA1P20036 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
HLA-DPA1P20036 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
HLA-DPA1P20036 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
HLA-DPA1P20036 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HLA-DPA1P20036 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
HLA-DPA1P20036 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
HLA-DPA1P20036 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
HLA-DPA1P20036 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
HLA-DPA1P20036 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
HLA-DPA1P20036 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.52■■□□□ 1.52
HLA-DPA1P20036 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
HLA-DPA1P20036 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
HLA-DPA1P20036 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
HLA-DPA1P20036 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HLA-DPA1P20036 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
HLA-DPA1P20036 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HLA-DPA1P20036 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HLA-DPA1P20036 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.51■■□□□ 1.51
HLA-DPA1P20036 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
HLA-DPA1P20036 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HLA-DPA1P20036 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HLA-DPA1P20036 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
HLA-DPA1P20036 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HLA-DPA1P20036 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HLA-DPA1P20036 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HLA-DPA1P20036 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HLA-DPA1P20036 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HLA-DPA1P20036 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
HLA-DPA1P20036 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
HLA-DPA1P20036 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
HLA-DPA1P20036 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
HLA-DPA1P20036 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
HLA-DPA1P20036 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HLA-DPA1P20036 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
HLA-DPA1P20036 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HLA-DPA1P20036 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
HLA-DPA1P20036 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
HLA-DPA1P20036 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
HLA-DPA1P20036 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HLA-DPA1P20036 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
HLA-DPA1P20036 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
HLA-DPA1P20036 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
HLA-DPA1P20036 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
HLA-DPA1P20036 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
HLA-DPA1P20036 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
HLA-DPA1P20036 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
HLA-DPA1P20036 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
HLA-DPA1P20036 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HLA-DPA1P20036 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
HLA-DPA1P20036 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HLA-DPA1P20036 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HLA-DPA1P20036 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HLA-DPA1P20036 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
HLA-DPA1P20036 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
HLA-DPA1P20036 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
HLA-DPA1P20036 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms