Protein–RNA interactions for Protein: P19474

TRIM21, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM21, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM21P19474 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TRIM21P19474 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TRIM21P19474 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
TRIM21P19474 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
TRIM21P19474 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
TRIM21P19474 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
TRIM21P19474 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
TRIM21P19474 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TRIM21P19474 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
TRIM21P19474 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
TRIM21P19474 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TRIM21P19474 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TRIM21P19474 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TRIM21P19474 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
TRIM21P19474 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TRIM21P19474 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
TRIM21P19474 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
TRIM21P19474 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TRIM21P19474 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TRIM21P19474 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TRIM21P19474 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TRIM21P19474 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TRIM21P19474 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
TRIM21P19474 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TRIM21P19474 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
TRIM21P19474 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
TRIM21P19474 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
TRIM21P19474 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TRIM21P19474 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TRIM21P19474 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
TRIM21P19474 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TRIM21P19474 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TRIM21P19474 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TRIM21P19474 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TRIM21P19474 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TRIM21P19474 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TRIM21P19474 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TRIM21P19474 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
TRIM21P19474 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
TRIM21P19474 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TRIM21P19474 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TRIM21P19474 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
TRIM21P19474 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
TRIM21P19474 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TRIM21P19474 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TRIM21P19474 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.65■■□□□ 1.86
TRIM21P19474 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC26.65■■□□□ 1.86
TRIM21P19474 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TRIM21P19474 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TRIM21P19474 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TRIM21P19474 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
TRIM21P19474 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TRIM21P19474 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
TRIM21P19474 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TRIM21P19474 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TRIM21P19474 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TRIM21P19474 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
TRIM21P19474 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TRIM21P19474 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TRIM21P19474 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
TRIM21P19474 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
TRIM21P19474 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
TRIM21P19474 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
TRIM21P19474 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
TRIM21P19474 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
TRIM21P19474 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
TRIM21P19474 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
TRIM21P19474 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
TRIM21P19474 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TRIM21P19474 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TRIM21P19474 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TRIM21P19474 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TRIM21P19474 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
TRIM21P19474 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TRIM21P19474 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC26.59■■□□□ 1.85
TRIM21P19474 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
TRIM21P19474 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
TRIM21P19474 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
TRIM21P19474 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
TRIM21P19474 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
TRIM21P19474 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
TRIM21P19474 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
TRIM21P19474 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
TRIM21P19474 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC26.57■■□□□ 1.84
TRIM21P19474 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
TRIM21P19474 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
TRIM21P19474 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TRIM21P19474 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
TRIM21P19474 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
TRIM21P19474 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TRIM21P19474 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
TRIM21P19474 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
TRIM21P19474 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TRIM21P19474 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TRIM21P19474 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
TRIM21P19474 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
TRIM21P19474 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TRIM21P19474 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TRIM21P19474 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TRIM21P19474 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms