Protein–RNA interactions for Protein: P17861

XBP1, X-box-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XBP1P17861 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
XBP1P17861 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
XBP1P17861 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
XBP1P17861 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
XBP1P17861 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
XBP1P17861 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
XBP1P17861 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
XBP1P17861 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
XBP1P17861 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
XBP1P17861 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
XBP1P17861 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
XBP1P17861 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
XBP1P17861 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
XBP1P17861 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC28.15■■■□□ 2.1
XBP1P17861 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
XBP1P17861 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
XBP1P17861 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
XBP1P17861 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
XBP1P17861 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
XBP1P17861 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
XBP1P17861 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
XBP1P17861 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
XBP1P17861 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
XBP1P17861 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
XBP1P17861 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.14■■■□□ 2.1
XBP1P17861 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
XBP1P17861 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
XBP1P17861 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.09
XBP1P17861 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.09
XBP1P17861 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
XBP1P17861 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
XBP1P17861 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
XBP1P17861 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
XBP1P17861 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
XBP1P17861 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
XBP1P17861 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC28.12■■■□□ 2.09
XBP1P17861 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
XBP1P17861 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
XBP1P17861 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
XBP1P17861 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
XBP1P17861 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
XBP1P17861 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
XBP1P17861 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
XBP1P17861 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
XBP1P17861 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
XBP1P17861 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
XBP1P17861 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
XBP1P17861 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
XBP1P17861 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
XBP1P17861 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
XBP1P17861 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
XBP1P17861 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
XBP1P17861 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
XBP1P17861 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
XBP1P17861 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC28.08■■■□□ 2.09
XBP1P17861 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
XBP1P17861 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
XBP1P17861 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
XBP1P17861 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
XBP1P17861 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
XBP1P17861 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
XBP1P17861 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
XBP1P17861 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
XBP1P17861 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
XBP1P17861 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
XBP1P17861 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
XBP1P17861 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
XBP1P17861 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
XBP1P17861 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
XBP1P17861 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
XBP1P17861 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
XBP1P17861 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC28.03■■■□□ 2.08
XBP1P17861 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
XBP1P17861 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
XBP1P17861 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
XBP1P17861 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
XBP1P17861 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
XBP1P17861 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
XBP1P17861 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
XBP1P17861 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
XBP1P17861 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC28■■■□□ 2.07
XBP1P17861 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC28■■■□□ 2.07
XBP1P17861 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
XBP1P17861 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
XBP1P17861 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
XBP1P17861 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
XBP1P17861 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
XBP1P17861 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
XBP1P17861 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
XBP1P17861 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
XBP1P17861 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
XBP1P17861 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
XBP1P17861 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
XBP1P17861 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
XBP1P17861 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
XBP1P17861 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
XBP1P17861 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
XBP1P17861 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
XBP1P17861 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
XBP1P17861 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.3 ms