Protein–RNA interactions for Protein: P17600

SYN1, Synapsin-1, humanhuman

Predictions only

Length 705 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYN1P17600 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SYN1P17600 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
SYN1P17600 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SYN1P17600 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SYN1P17600 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SYN1P17600 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SYN1P17600 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
SYN1P17600 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SYN1P17600 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SYN1P17600 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SYN1P17600 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SYN1P17600 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SYN1P17600 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
SYN1P17600 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SYN1P17600 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SYN1P17600 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SYN1P17600 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
SYN1P17600 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SYN1P17600 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SYN1P17600 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SYN1P17600 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
SYN1P17600 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SYN1P17600 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SYN1P17600 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SYN1P17600 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SYN1P17600 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SYN1P17600 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SYN1P17600 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SYN1P17600 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SYN1P17600 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SYN1P17600 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SYN1P17600 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SYN1P17600 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
SYN1P17600 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SYN1P17600 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SYN1P17600 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SYN1P17600 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SYN1P17600 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SYN1P17600 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SYN1P17600 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SYN1P17600 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SYN1P17600 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SYN1P17600 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SYN1P17600 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SYN1P17600 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SYN1P17600 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SYN1P17600 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SYN1P17600 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SYN1P17600 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SYN1P17600 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SYN1P17600 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SYN1P17600 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SYN1P17600 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SYN1P17600 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC27■■□□□ 1.91
SYN1P17600 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SYN1P17600 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SYN1P17600 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SYN1P17600 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SYN1P17600 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SYN1P17600 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SYN1P17600 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
SYN1P17600 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SYN1P17600 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SYN1P17600 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SYN1P17600 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SYN1P17600 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SYN1P17600 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SYN1P17600 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SYN1P17600 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SYN1P17600 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SYN1P17600 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SYN1P17600 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SYN1P17600 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SYN1P17600 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SYN1P17600 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SYN1P17600 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SYN1P17600 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SYN1P17600 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
SYN1P17600 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
SYN1P17600 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
SYN1P17600 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
SYN1P17600 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SYN1P17600 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SYN1P17600 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SYN1P17600 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SYN1P17600 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SYN1P17600 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
SYN1P17600 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SYN1P17600 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SYN1P17600 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SYN1P17600 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SYN1P17600 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SYN1P17600 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SYN1P17600 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SYN1P17600 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SYN1P17600 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SYN1P17600 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SYN1P17600 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SYN1P17600 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SYN1P17600 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14 ms