Protein–RNA interactions for Protein: P17036

ZNF3, Zinc finger protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 446 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF3P17036 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
ZNF3P17036 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
ZNF3P17036 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
ZNF3P17036 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
ZNF3P17036 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
ZNF3P17036 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
ZNF3P17036 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
ZNF3P17036 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
ZNF3P17036 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
ZNF3P17036 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ZNF3P17036 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ZNF3P17036 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ZNF3P17036 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ZNF3P17036 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ZNF3P17036 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ZNF3P17036 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ZNF3P17036 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ZNF3P17036 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ZNF3P17036 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ZNF3P17036 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ZNF3P17036 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ZNF3P17036 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ZNF3P17036 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ZNF3P17036 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ZNF3P17036 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ZNF3P17036 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
ZNF3P17036 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
ZNF3P17036 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
ZNF3P17036 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ZNF3P17036 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ZNF3P17036 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ZNF3P17036 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ZNF3P17036 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ZNF3P17036 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ZNF3P17036 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ZNF3P17036 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
ZNF3P17036 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ZNF3P17036 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ZNF3P17036 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ZNF3P17036 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ZNF3P17036 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ZNF3P17036 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ZNF3P17036 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ZNF3P17036 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ZNF3P17036 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ZNF3P17036 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ZNF3P17036 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ZNF3P17036 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ZNF3P17036 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ZNF3P17036 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ZNF3P17036 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ZNF3P17036 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ZNF3P17036 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ZNF3P17036 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ZNF3P17036 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ZNF3P17036 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ZNF3P17036 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ZNF3P17036 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
ZNF3P17036 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
ZNF3P17036 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
ZNF3P17036 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ZNF3P17036 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ZNF3P17036 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ZNF3P17036 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ZNF3P17036 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ZNF3P17036 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
ZNF3P17036 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
ZNF3P17036 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
ZNF3P17036 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ZNF3P17036 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ZNF3P17036 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
ZNF3P17036 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ZNF3P17036 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ZNF3P17036 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ZNF3P17036 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
ZNF3P17036 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ZNF3P17036 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ZNF3P17036 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
ZNF3P17036 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ZNF3P17036 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ZNF3P17036 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ZNF3P17036 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ZNF3P17036 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ZNF3P17036 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ZNF3P17036 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ZNF3P17036 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ZNF3P17036 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ZNF3P17036 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ZNF3P17036 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ZNF3P17036 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
ZNF3P17036 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ZNF3P17036 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ZNF3P17036 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ZNF3P17036 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ZNF3P17036 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ZNF3P17036 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ZNF3P17036 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ZNF3P17036 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ZNF3P17036 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ZNF3P17036 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms