Protein–RNA interactions for Protein: P15924

DSP, Desmoplakin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,871 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSPP15924 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
DSPP15924 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
DSPP15924 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
DSPP15924 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
DSPP15924 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
DSPP15924 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
DSPP15924 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
DSPP15924 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
DSPP15924 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
DSPP15924 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
DSPP15924 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
DSPP15924 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
DSPP15924 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
DSPP15924 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
DSPP15924 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
DSPP15924 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
DSPP15924 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
DSPP15924 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
DSPP15924 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
DSPP15924 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
DSPP15924 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
DSPP15924 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
DSPP15924 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
DSPP15924 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
DSPP15924 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
DSPP15924 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
DSPP15924 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
DSPP15924 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
DSPP15924 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
DSPP15924 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
DSPP15924 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
DSPP15924 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
DSPP15924 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
DSPP15924 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
DSPP15924 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
DSPP15924 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
DSPP15924 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
DSPP15924 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
DSPP15924 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
DSPP15924 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
DSPP15924 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
DSPP15924 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
DSPP15924 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
DSPP15924 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
DSPP15924 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
DSPP15924 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
DSPP15924 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
DSPP15924 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC23■■□□□ 1.27
DSPP15924 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
DSPP15924 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
DSPP15924 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
DSPP15924 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
DSPP15924 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
DSPP15924 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
DSPP15924 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
DSPP15924 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
DSPP15924 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
DSPP15924 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
DSPP15924 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
DSPP15924 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
DSPP15924 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.27
DSPP15924 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
DSPP15924 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
DSPP15924 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
DSPP15924 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
DSPP15924 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
DSPP15924 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
DSPP15924 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
DSPP15924 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
DSPP15924 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
DSPP15924 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
DSPP15924 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
DSPP15924 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
DSPP15924 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
DSPP15924 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
DSPP15924 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
DSPP15924 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
DSPP15924 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
DSPP15924 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
DSPP15924 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
DSPP15924 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
DSPP15924 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
DSPP15924 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
DSPP15924 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
DSPP15924 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
DSPP15924 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
DSPP15924 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
DSPP15924 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
DSPP15924 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
DSPP15924 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
DSPP15924 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
DSPP15924 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
DSPP15924 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
DSPP15924 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
DSPP15924 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
DSPP15924 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
DSPP15924 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
DSPP15924 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
DSPP15924 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.26
DSPP15924 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86 ms