Protein–RNA interactions for Protein: P15529

CD46, Membrane cofactor protein, humanhuman

Predictions only

Length 392 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD46P15529 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CD46P15529 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CD46P15529 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CD46P15529 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CD46P15529 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CD46P15529 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CD46P15529 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CD46P15529 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CD46P15529 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CD46P15529 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CD46P15529 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CD46P15529 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CD46P15529 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CD46P15529 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CD46P15529 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CD46P15529 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CD46P15529 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CD46P15529 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CD46P15529 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CD46P15529 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CD46P15529 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CD46P15529 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CD46P15529 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CD46P15529 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CD46P15529 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CD46P15529 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CD46P15529 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CD46P15529 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CD46P15529 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CD46P15529 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CD46P15529 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CD46P15529 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CD46P15529 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CD46P15529 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CD46P15529 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CD46P15529 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CD46P15529 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CD46P15529 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CD46P15529 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CD46P15529 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CD46P15529 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CD46P15529 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CD46P15529 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CD46P15529 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CD46P15529 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CD46P15529 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CD46P15529 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CD46P15529 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CD46P15529 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CD46P15529 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CD46P15529 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CD46P15529 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CD46P15529 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CD46P15529 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CD46P15529 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CD46P15529 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CD46P15529 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CD46P15529 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CD46P15529 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CD46P15529 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CD46P15529 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CD46P15529 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CD46P15529 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CD46P15529 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CD46P15529 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CD46P15529 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CD46P15529 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
CD46P15529 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CD46P15529 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CD46P15529 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CD46P15529 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CD46P15529 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CD46P15529 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CD46P15529 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CD46P15529 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CD46P15529 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CD46P15529 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CD46P15529 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CD46P15529 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CD46P15529 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CD46P15529 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CD46P15529 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CD46P15529 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CD46P15529 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CD46P15529 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CD46P15529 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CD46P15529 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CD46P15529 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CD46P15529 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CD46P15529 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CD46P15529 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CD46P15529 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CD46P15529 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CD46P15529 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CD46P15529 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CD46P15529 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CD46P15529 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CD46P15529 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CD46P15529 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CD46P15529 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.8 ms