Protein–RNA interactions for Protein: P13765

HLA-DOB, HLA class II histocompatibility antigen, DO beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DOBP13765 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HLA-DOBP13765 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HLA-DOBP13765 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HLA-DOBP13765 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HLA-DOBP13765 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HLA-DOBP13765 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
HLA-DOBP13765 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HLA-DOBP13765 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HLA-DOBP13765 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HLA-DOBP13765 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HLA-DOBP13765 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
HLA-DOBP13765 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
HLA-DOBP13765 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
HLA-DOBP13765 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
HLA-DOBP13765 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
HLA-DOBP13765 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
HLA-DOBP13765 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
HLA-DOBP13765 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HLA-DOBP13765 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
HLA-DOBP13765 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
HLA-DOBP13765 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
HLA-DOBP13765 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HLA-DOBP13765 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HLA-DOBP13765 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HLA-DOBP13765 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
HLA-DOBP13765 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
HLA-DOBP13765 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
HLA-DOBP13765 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
HLA-DOBP13765 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
HLA-DOBP13765 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
HLA-DOBP13765 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HLA-DOBP13765 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
HLA-DOBP13765 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HLA-DOBP13765 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HLA-DOBP13765 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
HLA-DOBP13765 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HLA-DOBP13765 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
HLA-DOBP13765 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
HLA-DOBP13765 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HLA-DOBP13765 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
HLA-DOBP13765 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HLA-DOBP13765 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HLA-DOBP13765 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HLA-DOBP13765 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HLA-DOBP13765 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HLA-DOBP13765 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HLA-DOBP13765 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
HLA-DOBP13765 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
HLA-DOBP13765 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
HLA-DOBP13765 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
HLA-DOBP13765 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
HLA-DOBP13765 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
HLA-DOBP13765 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
HLA-DOBP13765 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
HLA-DOBP13765 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
HLA-DOBP13765 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HLA-DOBP13765 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
HLA-DOBP13765 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
HLA-DOBP13765 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HLA-DOBP13765 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
HLA-DOBP13765 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HLA-DOBP13765 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HLA-DOBP13765 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
HLA-DOBP13765 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
HLA-DOBP13765 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HLA-DOBP13765 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HLA-DOBP13765 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.74■■□□□ 1.07
HLA-DOBP13765 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HLA-DOBP13765 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
HLA-DOBP13765 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
HLA-DOBP13765 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
HLA-DOBP13765 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HLA-DOBP13765 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HLA-DOBP13765 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
HLA-DOBP13765 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HLA-DOBP13765 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
HLA-DOBP13765 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
HLA-DOBP13765 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
HLA-DOBP13765 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HLA-DOBP13765 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HLA-DOBP13765 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HLA-DOBP13765 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HLA-DOBP13765 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HLA-DOBP13765 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HLA-DOBP13765 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HLA-DOBP13765 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HLA-DOBP13765 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
HLA-DOBP13765 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HLA-DOBP13765 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HLA-DOBP13765 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HLA-DOBP13765 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HLA-DOBP13765 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HLA-DOBP13765 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HLA-DOBP13765 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HLA-DOBP13765 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HLA-DOBP13765 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
HLA-DOBP13765 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
HLA-DOBP13765 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HLA-DOBP13765 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
HLA-DOBP13765 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 382.5 ms