Protein–RNA interactions for Protein: P13501

CCL5, C-C motif chemokine 5, humanhuman

Predictions only

Length 91 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL5P13501 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CCL5P13501 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CCL5P13501 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CCL5P13501 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CCL5P13501 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CCL5P13501 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CCL5P13501 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CCL5P13501 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CCL5P13501 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CCL5P13501 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CCL5P13501 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
CCL5P13501 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
CCL5P13501 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC27.7■■■□□ 2.02
CCL5P13501 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CCL5P13501 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CCL5P13501 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CCL5P13501 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CCL5P13501 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CCL5P13501 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CCL5P13501 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CCL5P13501 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CCL5P13501 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CCL5P13501 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CCL5P13501 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CCL5P13501 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CCL5P13501 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CCL5P13501 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CCL5P13501 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CCL5P13501 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CCL5P13501 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CCL5P13501 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CCL5P13501 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CCL5P13501 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
CCL5P13501 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
CCL5P13501 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CCL5P13501 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CCL5P13501 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CCL5P13501 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CCL5P13501 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CCL5P13501 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CCL5P13501 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CCL5P13501 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CCL5P13501 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CCL5P13501 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CCL5P13501 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CCL5P13501 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CCL5P13501 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CCL5P13501 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
CCL5P13501 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CCL5P13501 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CCL5P13501 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CCL5P13501 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CCL5P13501 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CCL5P13501 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CCL5P13501 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CCL5P13501 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CCL5P13501 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CCL5P13501 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CCL5P13501 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CCL5P13501 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CCL5P13501 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CCL5P13501 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CCL5P13501 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CCL5P13501 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CCL5P13501 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
CCL5P13501 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CCL5P13501 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
CCL5P13501 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CCL5P13501 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
CCL5P13501 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
CCL5P13501 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CCL5P13501 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CCL5P13501 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC27.57■■■□□ 2
CCL5P13501 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
CCL5P13501 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC27.57■■■□□ 2
CCL5P13501 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC27.57■■■□□ 2
CCL5P13501 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CCL5P13501 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CCL5P13501 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.56■■■□□ 2
CCL5P13501 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.56■■■□□ 2
CCL5P13501 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
CCL5P13501 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
CCL5P13501 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CCL5P13501 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CCL5P13501 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CCL5P13501 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC27.55■■■□□ 2
CCL5P13501 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
CCL5P13501 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
CCL5P13501 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC27.55■■■□□ 2
CCL5P13501 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
CCL5P13501 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC27.55■■■□□ 2
CCL5P13501 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
CCL5P13501 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC27.55■■■□□ 2
CCL5P13501 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CCL5P13501 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CCL5P13501 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
CCL5P13501 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC27.55■■■□□ 2
CCL5P13501 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CCL5P13501 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CCL5P13501 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 186.3 ms