Protein–RNA interactions for Protein: P12955

PEPD, Xaa-Pro dipeptidase, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEPDP12955 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PEPDP12955 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PEPDP12955 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PEPDP12955 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
PEPDP12955 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PEPDP12955 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PEPDP12955 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PEPDP12955 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PEPDP12955 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PEPDP12955 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PEPDP12955 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PEPDP12955 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PEPDP12955 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
PEPDP12955 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PEPDP12955 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PEPDP12955 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PEPDP12955 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PEPDP12955 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
PEPDP12955 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PEPDP12955 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PEPDP12955 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PEPDP12955 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PEPDP12955 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PEPDP12955 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PEPDP12955 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PEPDP12955 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PEPDP12955 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PEPDP12955 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PEPDP12955 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PEPDP12955 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PEPDP12955 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PEPDP12955 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
PEPDP12955 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PEPDP12955 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PEPDP12955 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PEPDP12955 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PEPDP12955 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PEPDP12955 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
PEPDP12955 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PEPDP12955 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PEPDP12955 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PEPDP12955 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PEPDP12955 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PEPDP12955 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PEPDP12955 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PEPDP12955 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PEPDP12955 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
PEPDP12955 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PEPDP12955 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PEPDP12955 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PEPDP12955 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
PEPDP12955 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PEPDP12955 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PEPDP12955 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PEPDP12955 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PEPDP12955 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PEPDP12955 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PEPDP12955 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PEPDP12955 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PEPDP12955 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PEPDP12955 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PEPDP12955 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
PEPDP12955 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PEPDP12955 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PEPDP12955 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PEPDP12955 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PEPDP12955 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PEPDP12955 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PEPDP12955 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PEPDP12955 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PEPDP12955 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PEPDP12955 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PEPDP12955 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PEPDP12955 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PEPDP12955 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PEPDP12955 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PEPDP12955 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PEPDP12955 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PEPDP12955 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PEPDP12955 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PEPDP12955 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PEPDP12955 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PEPDP12955 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PEPDP12955 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
PEPDP12955 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PEPDP12955 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
PEPDP12955 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PEPDP12955 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PEPDP12955 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PEPDP12955 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PEPDP12955 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PEPDP12955 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PEPDP12955 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
PEPDP12955 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PEPDP12955 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PEPDP12955 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PEPDP12955 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PEPDP12955 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PEPDP12955 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PEPDP12955 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms