Protein–RNA interactions for Protein: P11230

CHRNB1, Acetylcholine receptor subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNB1P11230 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CHRNB1P11230 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CHRNB1P11230 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CHRNB1P11230 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CHRNB1P11230 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CHRNB1P11230 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CHRNB1P11230 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CHRNB1P11230 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CHRNB1P11230 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CHRNB1P11230 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CHRNB1P11230 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CHRNB1P11230 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CHRNB1P11230 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
CHRNB1P11230 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CHRNB1P11230 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CHRNB1P11230 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CHRNB1P11230 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CHRNB1P11230 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CHRNB1P11230 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CHRNB1P11230 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CHRNB1P11230 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
CHRNB1P11230 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CHRNB1P11230 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CHRNB1P11230 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CHRNB1P11230 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CHRNB1P11230 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CHRNB1P11230 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CHRNB1P11230 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CHRNB1P11230 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CHRNB1P11230 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CHRNB1P11230 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CHRNB1P11230 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CHRNB1P11230 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CHRNB1P11230 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CHRNB1P11230 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CHRNB1P11230 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CHRNB1P11230 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CHRNB1P11230 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CHRNB1P11230 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CHRNB1P11230 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CHRNB1P11230 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CHRNB1P11230 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
CHRNB1P11230 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CHRNB1P11230 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CHRNB1P11230 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CHRNB1P11230 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CHRNB1P11230 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CHRNB1P11230 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CHRNB1P11230 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CHRNB1P11230 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
CHRNB1P11230 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CHRNB1P11230 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CHRNB1P11230 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CHRNB1P11230 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CHRNB1P11230 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
CHRNB1P11230 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CHRNB1P11230 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CHRNB1P11230 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CHRNB1P11230 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CHRNB1P11230 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CHRNB1P11230 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CHRNB1P11230 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CHRNB1P11230 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CHRNB1P11230 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CHRNB1P11230 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CHRNB1P11230 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CHRNB1P11230 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CHRNB1P11230 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CHRNB1P11230 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CHRNB1P11230 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CHRNB1P11230 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CHRNB1P11230 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CHRNB1P11230 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CHRNB1P11230 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CHRNB1P11230 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CHRNB1P11230 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CHRNB1P11230 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CHRNB1P11230 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CHRNB1P11230 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CHRNB1P11230 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CHRNB1P11230 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CHRNB1P11230 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CHRNB1P11230 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CHRNB1P11230 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CHRNB1P11230 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CHRNB1P11230 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CHRNB1P11230 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CHRNB1P11230 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CHRNB1P11230 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CHRNB1P11230 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CHRNB1P11230 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CHRNB1P11230 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CHRNB1P11230 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CHRNB1P11230 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CHRNB1P11230 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
CHRNB1P11230 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CHRNB1P11230 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CHRNB1P11230 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
CHRNB1P11230 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CHRNB1P11230 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.5 ms