Protein–RNA interactions for Protein: P0DJR0

GIMD1, GTPase IMAP family member GIMD1, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIMD1P0DJR0 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
GIMD1P0DJR0 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
GIMD1P0DJR0 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
GIMD1P0DJR0 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
GIMD1P0DJR0 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
GIMD1P0DJR0 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
GIMD1P0DJR0 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
GIMD1P0DJR0 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GIMD1P0DJR0 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GIMD1P0DJR0 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GIMD1P0DJR0 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GIMD1P0DJR0 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
GIMD1P0DJR0 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
GIMD1P0DJR0 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GIMD1P0DJR0 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GIMD1P0DJR0 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
GIMD1P0DJR0 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
GIMD1P0DJR0 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GIMD1P0DJR0 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
GIMD1P0DJR0 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GIMD1P0DJR0 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
GIMD1P0DJR0 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GIMD1P0DJR0 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
GIMD1P0DJR0 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
GIMD1P0DJR0 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GIMD1P0DJR0 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
GIMD1P0DJR0 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GIMD1P0DJR0 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GIMD1P0DJR0 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GIMD1P0DJR0 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
GIMD1P0DJR0 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
GIMD1P0DJR0 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
GIMD1P0DJR0 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
GIMD1P0DJR0 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
GIMD1P0DJR0 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
GIMD1P0DJR0 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
GIMD1P0DJR0 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GIMD1P0DJR0 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
GIMD1P0DJR0 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
GIMD1P0DJR0 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
GIMD1P0DJR0 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GIMD1P0DJR0 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
GIMD1P0DJR0 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
GIMD1P0DJR0 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GIMD1P0DJR0 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GIMD1P0DJR0 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GIMD1P0DJR0 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
GIMD1P0DJR0 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
GIMD1P0DJR0 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
GIMD1P0DJR0 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
GIMD1P0DJR0 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
GIMD1P0DJR0 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
GIMD1P0DJR0 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GIMD1P0DJR0 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
GIMD1P0DJR0 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
GIMD1P0DJR0 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
GIMD1P0DJR0 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GIMD1P0DJR0 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GIMD1P0DJR0 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GIMD1P0DJR0 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
GIMD1P0DJR0 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GIMD1P0DJR0 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
GIMD1P0DJR0 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
GIMD1P0DJR0 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GIMD1P0DJR0 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GIMD1P0DJR0 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GIMD1P0DJR0 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
GIMD1P0DJR0 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
GIMD1P0DJR0 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
GIMD1P0DJR0 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GIMD1P0DJR0 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
GIMD1P0DJR0 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
GIMD1P0DJR0 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC23.77■■□□□ 1.4
GIMD1P0DJR0 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
GIMD1P0DJR0 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GIMD1P0DJR0 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
GIMD1P0DJR0 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GIMD1P0DJR0 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GIMD1P0DJR0 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
GIMD1P0DJR0 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
GIMD1P0DJR0 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GIMD1P0DJR0 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
GIMD1P0DJR0 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GIMD1P0DJR0 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
GIMD1P0DJR0 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
GIMD1P0DJR0 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GIMD1P0DJR0 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
GIMD1P0DJR0 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GIMD1P0DJR0 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GIMD1P0DJR0 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
GIMD1P0DJR0 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
GIMD1P0DJR0 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
GIMD1P0DJR0 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
GIMD1P0DJR0 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
GIMD1P0DJR0 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
GIMD1P0DJR0 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GIMD1P0DJR0 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GIMD1P0DJR0 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GIMD1P0DJR0 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
GIMD1P0DJR0 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms