Protein–RNA interactions for Protein: P0C860

MSL3P1, Putative male-specific lethal-3 protein-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSL3P1P0C860 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
MSL3P1P0C860 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
MSL3P1P0C860 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MSL3P1P0C860 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MSL3P1P0C860 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MSL3P1P0C860 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
MSL3P1P0C860 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MSL3P1P0C860 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MSL3P1P0C860 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MSL3P1P0C860 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MSL3P1P0C860 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MSL3P1P0C860 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MSL3P1P0C860 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MSL3P1P0C860 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MSL3P1P0C860 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MSL3P1P0C860 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MSL3P1P0C860 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MSL3P1P0C860 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MSL3P1P0C860 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MSL3P1P0C860 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MSL3P1P0C860 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MSL3P1P0C860 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MSL3P1P0C860 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MSL3P1P0C860 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MSL3P1P0C860 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MSL3P1P0C860 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MSL3P1P0C860 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MSL3P1P0C860 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MSL3P1P0C860 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MSL3P1P0C860 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MSL3P1P0C860 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MSL3P1P0C860 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MSL3P1P0C860 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MSL3P1P0C860 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MSL3P1P0C860 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
MSL3P1P0C860 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MSL3P1P0C860 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
MSL3P1P0C860 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
MSL3P1P0C860 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MSL3P1P0C860 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MSL3P1P0C860 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MSL3P1P0C860 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MSL3P1P0C860 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
MSL3P1P0C860 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MSL3P1P0C860 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MSL3P1P0C860 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MSL3P1P0C860 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MSL3P1P0C860 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MSL3P1P0C860 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MSL3P1P0C860 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MSL3P1P0C860 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MSL3P1P0C860 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MSL3P1P0C860 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MSL3P1P0C860 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MSL3P1P0C860 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MSL3P1P0C860 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MSL3P1P0C860 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MSL3P1P0C860 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
MSL3P1P0C860 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MSL3P1P0C860 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MSL3P1P0C860 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MSL3P1P0C860 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MSL3P1P0C860 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MSL3P1P0C860 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MSL3P1P0C860 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
MSL3P1P0C860 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MSL3P1P0C860 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MSL3P1P0C860 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MSL3P1P0C860 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
MSL3P1P0C860 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
MSL3P1P0C860 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
MSL3P1P0C860 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
MSL3P1P0C860 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
MSL3P1P0C860 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MSL3P1P0C860 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
MSL3P1P0C860 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
MSL3P1P0C860 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MSL3P1P0C860 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MSL3P1P0C860 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MSL3P1P0C860 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MSL3P1P0C860 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MSL3P1P0C860 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
MSL3P1P0C860 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MSL3P1P0C860 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MSL3P1P0C860 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
MSL3P1P0C860 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MSL3P1P0C860 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MSL3P1P0C860 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MSL3P1P0C860 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MSL3P1P0C860 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MSL3P1P0C860 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MSL3P1P0C860 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MSL3P1P0C860 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MSL3P1P0C860 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MSL3P1P0C860 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MSL3P1P0C860 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MSL3P1P0C860 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MSL3P1P0C860 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
MSL3P1P0C860 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MSL3P1P0C860 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12 ms