Protein–RNA interactions for Protein: P09619

PDGFRB, Platelet-derived growth factor receptor beta, humanhuman

Predictions only

Length 1,106 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDGFRBP09619 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PDGFRBP09619 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
PDGFRBP09619 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PDGFRBP09619 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PDGFRBP09619 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PDGFRBP09619 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PDGFRBP09619 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PDGFRBP09619 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PDGFRBP09619 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PDGFRBP09619 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PDGFRBP09619 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PDGFRBP09619 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PDGFRBP09619 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PDGFRBP09619 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PDGFRBP09619 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PDGFRBP09619 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PDGFRBP09619 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PDGFRBP09619 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PDGFRBP09619 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PDGFRBP09619 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PDGFRBP09619 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PDGFRBP09619 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PDGFRBP09619 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PDGFRBP09619 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PDGFRBP09619 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PDGFRBP09619 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
PDGFRBP09619 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC26■■□□□ 1.75
PDGFRBP09619 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PDGFRBP09619 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PDGFRBP09619 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PDGFRBP09619 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PDGFRBP09619 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PDGFRBP09619 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PDGFRBP09619 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
PDGFRBP09619 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PDGFRBP09619 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PDGFRBP09619 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PDGFRBP09619 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PDGFRBP09619 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
PDGFRBP09619 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PDGFRBP09619 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PDGFRBP09619 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PDGFRBP09619 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PDGFRBP09619 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PDGFRBP09619 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PDGFRBP09619 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PDGFRBP09619 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
PDGFRBP09619 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PDGFRBP09619 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PDGFRBP09619 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PDGFRBP09619 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
PDGFRBP09619 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PDGFRBP09619 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
PDGFRBP09619 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PDGFRBP09619 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PDGFRBP09619 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PDGFRBP09619 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PDGFRBP09619 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PDGFRBP09619 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PDGFRBP09619 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PDGFRBP09619 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PDGFRBP09619 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PDGFRBP09619 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
PDGFRBP09619 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PDGFRBP09619 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PDGFRBP09619 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PDGFRBP09619 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PDGFRBP09619 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PDGFRBP09619 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PDGFRBP09619 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PDGFRBP09619 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PDGFRBP09619 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PDGFRBP09619 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PDGFRBP09619 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PDGFRBP09619 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
PDGFRBP09619 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
PDGFRBP09619 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PDGFRBP09619 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
PDGFRBP09619 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PDGFRBP09619 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PDGFRBP09619 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PDGFRBP09619 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
PDGFRBP09619 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PDGFRBP09619 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PDGFRBP09619 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
PDGFRBP09619 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PDGFRBP09619 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PDGFRBP09619 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PDGFRBP09619 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PDGFRBP09619 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PDGFRBP09619 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PDGFRBP09619 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PDGFRBP09619 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PDGFRBP09619 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PDGFRBP09619 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PDGFRBP09619 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PDGFRBP09619 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PDGFRBP09619 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PDGFRBP09619 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PDGFRBP09619 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms