Protein–RNA interactions for Protein: P08962

CD63, CD63 antigen, humanhuman

Predictions only

Length 238 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD63P08962 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CD63P08962 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CD63P08962 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CD63P08962 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CD63P08962 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CD63P08962 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CD63P08962 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CD63P08962 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CD63P08962 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CD63P08962 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CD63P08962 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CD63P08962 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CD63P08962 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CD63P08962 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
CD63P08962 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CD63P08962 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CD63P08962 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CD63P08962 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CD63P08962 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CD63P08962 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CD63P08962 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CD63P08962 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CD63P08962 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CD63P08962 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CD63P08962 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CD63P08962 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CD63P08962 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CD63P08962 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CD63P08962 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CD63P08962 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CD63P08962 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CD63P08962 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CD63P08962 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CD63P08962 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CD63P08962 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CD63P08962 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CD63P08962 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CD63P08962 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CD63P08962 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CD63P08962 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CD63P08962 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CD63P08962 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CD63P08962 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CD63P08962 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CD63P08962 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CD63P08962 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CD63P08962 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CD63P08962 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CD63P08962 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CD63P08962 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CD63P08962 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CD63P08962 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CD63P08962 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
CD63P08962 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CD63P08962 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CD63P08962 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CD63P08962 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CD63P08962 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CD63P08962 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CD63P08962 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CD63P08962 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CD63P08962 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CD63P08962 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CD63P08962 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CD63P08962 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CD63P08962 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CD63P08962 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CD63P08962 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CD63P08962 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CD63P08962 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CD63P08962 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CD63P08962 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CD63P08962 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CD63P08962 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CD63P08962 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CD63P08962 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CD63P08962 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CD63P08962 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CD63P08962 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CD63P08962 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CD63P08962 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CD63P08962 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CD63P08962 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CD63P08962 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CD63P08962 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CD63P08962 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CD63P08962 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CD63P08962 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CD63P08962 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CD63P08962 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CD63P08962 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CD63P08962 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CD63P08962 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CD63P08962 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CD63P08962 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CD63P08962 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CD63P08962 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CD63P08962 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CD63P08962 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CD63P08962 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms