Protein–RNA interactions for Protein: P07357

C8A, Complement component C8 alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 584 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C8AP07357 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
C8AP07357 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
C8AP07357 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
C8AP07357 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
C8AP07357 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
C8AP07357 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
C8AP07357 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
C8AP07357 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
C8AP07357 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
C8AP07357 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
C8AP07357 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
C8AP07357 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
C8AP07357 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
C8AP07357 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
C8AP07357 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
C8AP07357 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
C8AP07357 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
C8AP07357 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
C8AP07357 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
C8AP07357 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
C8AP07357 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
C8AP07357 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
C8AP07357 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
C8AP07357 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
C8AP07357 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
C8AP07357 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
C8AP07357 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
C8AP07357 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
C8AP07357 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
C8AP07357 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
C8AP07357 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
C8AP07357 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
C8AP07357 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
C8AP07357 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
C8AP07357 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
C8AP07357 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
C8AP07357 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
C8AP07357 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
C8AP07357 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
C8AP07357 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
C8AP07357 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
C8AP07357 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
C8AP07357 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
C8AP07357 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
C8AP07357 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
C8AP07357 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
C8AP07357 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
C8AP07357 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
C8AP07357 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
C8AP07357 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
C8AP07357 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
C8AP07357 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
C8AP07357 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
C8AP07357 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
C8AP07357 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
C8AP07357 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
C8AP07357 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
C8AP07357 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
C8AP07357 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
C8AP07357 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
C8AP07357 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
C8AP07357 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
C8AP07357 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
C8AP07357 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
C8AP07357 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
C8AP07357 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
C8AP07357 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
C8AP07357 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
C8AP07357 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
C8AP07357 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
C8AP07357 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
C8AP07357 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
C8AP07357 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
C8AP07357 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
C8AP07357 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
C8AP07357 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
C8AP07357 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
C8AP07357 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
C8AP07357 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
C8AP07357 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
C8AP07357 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
C8AP07357 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC25.62■■□□□ 1.69
C8AP07357 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
C8AP07357 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
C8AP07357 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
C8AP07357 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
C8AP07357 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
C8AP07357 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
C8AP07357 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
C8AP07357 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
C8AP07357 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
C8AP07357 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
C8AP07357 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
C8AP07357 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
C8AP07357 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
C8AP07357 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
C8AP07357 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
C8AP07357 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
C8AP07357 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
C8AP07357 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 193.9 ms