Protein–RNA interactions for Protein: P05771

PRKCB, Protein kinase C beta type, humanhuman

Predictions only

Length 671 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCBP05771 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
PRKCBP05771 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PRKCBP05771 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PRKCBP05771 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PRKCBP05771 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PRKCBP05771 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PRKCBP05771 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
PRKCBP05771 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PRKCBP05771 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
PRKCBP05771 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PRKCBP05771 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PRKCBP05771 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PRKCBP05771 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PRKCBP05771 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PRKCBP05771 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PRKCBP05771 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PRKCBP05771 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PRKCBP05771 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PRKCBP05771 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PRKCBP05771 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PRKCBP05771 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PRKCBP05771 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PRKCBP05771 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
PRKCBP05771 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PRKCBP05771 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PRKCBP05771 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PRKCBP05771 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PRKCBP05771 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PRKCBP05771 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PRKCBP05771 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
PRKCBP05771 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
PRKCBP05771 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PRKCBP05771 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
PRKCBP05771 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
PRKCBP05771 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
PRKCBP05771 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PRKCBP05771 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PRKCBP05771 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
PRKCBP05771 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PRKCBP05771 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PRKCBP05771 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PRKCBP05771 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PRKCBP05771 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PRKCBP05771 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PRKCBP05771 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PRKCBP05771 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PRKCBP05771 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PRKCBP05771 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
PRKCBP05771 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PRKCBP05771 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PRKCBP05771 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PRKCBP05771 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PRKCBP05771 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PRKCBP05771 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PRKCBP05771 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PRKCBP05771 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PRKCBP05771 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PRKCBP05771 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PRKCBP05771 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PRKCBP05771 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PRKCBP05771 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PRKCBP05771 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PRKCBP05771 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PRKCBP05771 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PRKCBP05771 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PRKCBP05771 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
PRKCBP05771 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
PRKCBP05771 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
PRKCBP05771 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
PRKCBP05771 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
PRKCBP05771 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PRKCBP05771 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PRKCBP05771 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
PRKCBP05771 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
PRKCBP05771 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PRKCBP05771 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PRKCBP05771 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PRKCBP05771 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PRKCBP05771 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PRKCBP05771 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PRKCBP05771 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PRKCBP05771 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PRKCBP05771 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PRKCBP05771 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PRKCBP05771 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PRKCBP05771 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PRKCBP05771 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PRKCBP05771 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PRKCBP05771 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PRKCBP05771 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PRKCBP05771 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PRKCBP05771 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PRKCBP05771 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PRKCBP05771 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PRKCBP05771 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PRKCBP05771 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PRKCBP05771 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PRKCBP05771 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PRKCBP05771 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PRKCBP05771 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms