Protein–RNA interactions for Protein: P04908

HIST1H2AB, Histone H2A type 1-B/E, humanhuman

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIST1H2ABP04908 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HIST1H2ABP04908 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HIST1H2ABP04908 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HIST1H2ABP04908 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HIST1H2ABP04908 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HIST1H2ABP04908 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HIST1H2ABP04908 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HIST1H2ABP04908 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HIST1H2ABP04908 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HIST1H2ABP04908 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HIST1H2ABP04908 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HIST1H2ABP04908 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HIST1H2ABP04908 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HIST1H2ABP04908 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HIST1H2ABP04908 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HIST1H2ABP04908 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HIST1H2ABP04908 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HIST1H2ABP04908 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HIST1H2ABP04908 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HIST1H2ABP04908 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HIST1H2ABP04908 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HIST1H2ABP04908 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HIST1H2ABP04908 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HIST1H2ABP04908 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HIST1H2ABP04908 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HIST1H2ABP04908 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HIST1H2ABP04908 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HIST1H2ABP04908 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HIST1H2ABP04908 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HIST1H2ABP04908 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HIST1H2ABP04908 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HIST1H2ABP04908 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HIST1H2ABP04908 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HIST1H2ABP04908 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HIST1H2ABP04908 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HIST1H2ABP04908 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HIST1H2ABP04908 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HIST1H2ABP04908 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.02■■□□□ 1.11
HIST1H2ABP04908 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HIST1H2ABP04908 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HIST1H2ABP04908 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HIST1H2ABP04908 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HIST1H2ABP04908 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HIST1H2ABP04908 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HIST1H2ABP04908 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HIST1H2ABP04908 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
HIST1H2ABP04908 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HIST1H2ABP04908 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
HIST1H2ABP04908 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HIST1H2ABP04908 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HIST1H2ABP04908 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HIST1H2ABP04908 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HIST1H2ABP04908 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HIST1H2ABP04908 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HIST1H2ABP04908 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HIST1H2ABP04908 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HIST1H2ABP04908 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HIST1H2ABP04908 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HIST1H2ABP04908 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HIST1H2ABP04908 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HIST1H2ABP04908 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HIST1H2ABP04908 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HIST1H2ABP04908 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HIST1H2ABP04908 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HIST1H2ABP04908 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HIST1H2ABP04908 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HIST1H2ABP04908 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HIST1H2ABP04908 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HIST1H2ABP04908 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HIST1H2ABP04908 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HIST1H2ABP04908 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HIST1H2ABP04908 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HIST1H2ABP04908 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HIST1H2ABP04908 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HIST1H2ABP04908 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
HIST1H2ABP04908 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
HIST1H2ABP04908 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HIST1H2ABP04908 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
HIST1H2ABP04908 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HIST1H2ABP04908 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HIST1H2ABP04908 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HIST1H2ABP04908 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HIST1H2ABP04908 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HIST1H2ABP04908 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HIST1H2ABP04908 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HIST1H2ABP04908 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
HIST1H2ABP04908 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
HIST1H2ABP04908 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
HIST1H2ABP04908 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
HIST1H2ABP04908 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
HIST1H2ABP04908 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
HIST1H2ABP04908 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
HIST1H2ABP04908 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HIST1H2ABP04908 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HIST1H2ABP04908 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
HIST1H2ABP04908 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HIST1H2ABP04908 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HIST1H2ABP04908 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HIST1H2ABP04908 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HIST1H2ABP04908 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11 ms